191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0112 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3586  Radical SAM domain protein  53.75 
 
 		 732 aa  784    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00751133 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0089  Radical SAM domain protein  52.33 
 
 		 643 aa  658    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0112  Fe-S oxidoreductase  100 
 
 		 726 aa  1511    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0105  radical SAM domain-containing protein  52.81 
 
 		 636 aa  670    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0050  radical SAM domain-containing protein  51.37 
 
 		 707 aa  667    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1420  radical SAM domain-containing protein  50.64 
 
 		 632 aa  640    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4972  radical SAM domain-containing protein  52.62 
 
 		 738 aa  783    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991033  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1777  Radical SAM domain protein  54.08 
 
 		 737 aa  798    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.54513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4370  radical SAM domain-containing protein  51.7 
 
 		 634 aa  644    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0070  Radical SAM domain protein  51.53 
 
 		 635 aa  671    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2787  Radical SAM domain protein  54.84 
 
 		 732 aa  828    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.231637  normal  0.0637853 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0246  radical SAM domain-containing protein  49.22 
 
 		 647 aa  633  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1155  radical SAM family protein  47.9 
 
 		 658 aa  626  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1481  radical SAM family protein  48.19 
 
 		 644 aa  622  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.177835  normal  0.151823 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2276  radical SAM domain-containing protein  48.19 
 
 		 642 aa  623  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.315011  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1855  radical SAM family protein  50.4 
 
 		 638 aa  619  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.357803 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3504  radical SAM domain-containing protein  48.98 
 
 		 646 aa  620  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3570  radical SAM domain-containing protein  48.82 
 
 		 658 aa  616  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2450  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 590 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1423  radical SAM/B12 binding domain protein  28.29 
 
 		 715 aa  134  5e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.623089  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0533  radical SAM domain protein  58.25 
 
 		 138 aa  132  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0245  radical SAM family protein  26.53 
 
 		 502 aa  104  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000162793  hitchhiker  0.0000142762 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2521  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 531 aa  100  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0155875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3373  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 		 503 aa  100  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0213  radical SAM domain-containing protein  30.34 
 
 		 429 aa  99  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2989  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 500 aa  97.8  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0098  radical SAM domain-containing protein  29.88 
 
 		 716 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  28.52 
 
 		 705 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2210  radical SAM domain-containing protein  28.14 
 
 		 565 aa  93.6  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2019  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 525 aa  82.8  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0788272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0968  Radical SAM domain protein  23.06 
 
 		 630 aa  80.9  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0879  radical SAM family Fe-S protein  23.89 
 
 		 488 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2379  Radical SAM domain protein  23.59 
 
 		 623 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  23.51 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  23.51 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.88 
 
 		 546 aa  73.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.908643  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  22.08 
 
 		 494 aa  72.8  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  22.08 
 
 		 494 aa  72.8  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0229  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.41 
 
 		 547 aa  72.4  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2209  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.92 
 
 		 546 aa  71.6  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.561885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4778  response regulator receiver protein  25.23 
 
 		 675 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0104454 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1863  radical SAM family protein  21.77 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300057  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2315  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.92 
 
 		 546 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.03087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3552  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 		 488 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2292  radical SAM domain-containing protein  22.8 
 
 		 634 aa  69.7  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2894  radical SAM family protein  28.9 
 
 		 613 aa  69.3  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0316  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.84 
 
 		 567 aa  68.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0512  Radical SAM domain protein  21.04 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  22.7 
 
 		 529 aa  68.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6404  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase 66kD subunit  23.48 
 
 		 534 aa  68.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0251  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.34 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.42517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2158  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.35 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1157  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  22.77 
 
 		 459 aa  67.4  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1976  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.65 
 
 		 546 aa  66.6  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175578  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 528 aa  66.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3422  Radical SAM domain protein  21.76 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2566  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 		 1250 aa  63.9  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  22.84 
 
 		 864 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 		 471 aa  63.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  23.35 
 
 		 469 aa  63.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1537  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.19 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.537529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3233  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 531 aa  61.2  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  23.16 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  24.17 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1625  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.25 
 
 		 558 aa  60.8  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3548  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.97 
 
 		 535 aa  60.1  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  35.42 
 
 		 444 aa  60.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  23.66 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.33 
 
 		 548 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  20.31 
 
 		 518 aa  58.9  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1590  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3401  Radical SAM domain protein  22.73 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  20.35 
 
 		 723 aa  58.2  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  22.02 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0597  radical SAM family protein  21.88 
 
 		 501 aa  57.4  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.678652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  23.51 
 
 		 521 aa  57.4  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0820  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 583 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  21.85 
 
 		 473 aa  57  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1119  radical SAM domain-containing protein  22.9 
 
 		 525 aa  57  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0138505  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 520 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4068  Radical SAM domain protein  21.09 
 
 		 633 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0722964  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  22.36 
 
 		 548 aa  56.2  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2387  cobalamin B12-binding domain protein  23.39 
 
 		 545 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 		 488 aa  55.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4087  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 458 aa  55.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  21.9 
 
 		 524 aa  55.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  22.02 
 
 		 460 aa  55.1  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0516  radical SAM domain-containing protein  20.55 
 
 		 501 aa  54.7  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 		 487 aa  54.7  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 461 aa  54.3  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  25.48 
 
 		 484 aa  54.3  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1302  Radical SAM domain protein  22.57 
 
 		 540 aa  54.3  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0143596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4198  radical SAM domain-containing protein  20.61 
 
 		 620 aa  53.9  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3370  cobalamin B12-binding  24.09 
 
 		 618 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.818313  normal  0.0333946 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0874  radical SAM family Fe-S protein  26.47 
 
 		 501 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  21.19 
 
 		 552 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>