More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0879 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0879  radical SAM family Fe-S protein  100 
 
 		 488 aa  1015    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0873  radical SAM family Fe-S protein  29.64 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0874  radical SAM family Fe-S protein  27.68 
 
 		 501 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  30.49 
 
 		 494 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  30.49 
 
 		 494 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  29.93 
 
 		 494 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  29.68 
 
 		 494 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 		 459 aa  146  8.000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  23.98 
 
 		 533 aa  125  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  28.68 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.37 
 
 		 441 aa  121  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 		 441 aa  117  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 		 529 aa  118  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  27.07 
 
 		 518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4090  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1423  radical SAM/B12 binding domain protein  26.84 
 
 		 715 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.623089  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.15 
 
 		 476 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 		 487 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  26.27 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 476 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 502 aa  108  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 489 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 521 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  28.47 
 
 		 681 aa  107  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 524 aa  106  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3401  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 461 aa  104  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  27.82 
 
 		 488 aa  104  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 1288 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  26.49 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0516  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 501 aa  101  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0204  radical SAM domain-containing protein  29.73 
 
 		 452 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.306375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3533  Radical SAM domain protein  29.8 
 
 		 506 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1165  Radical SAM domain protein  29.8 
 
 		 506 aa  100  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  26.11 
 
 		 472 aa  100  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  27.92 
 
 		 476 aa  99.8  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  25.58 
 
 		 475 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2472  radical SAM domain-containing protein  23.82 
 
 		 507 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  26.09 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  24.59 
 
 		 459 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.21 
 
 		 473 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 468 aa  99  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3467  Radical SAM domain protein  29.47 
 
 		 506 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  25.25 
 
 		 472 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.55 
 
 		 473 aa  99  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 		 1250 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  24.94 
 
 		 472 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  23.87 
 
 		 723 aa  98.2  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 528 aa  97.8  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  26.29 
 
 		 864 aa  97.1  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1119  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 525 aa  96.3  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0138505  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.82 
 
 		 674 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1029  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 472 aa  95.5  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0876  radical SAM family Fe-S protein  27.47 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3231  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 		 472 aa  94.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  24.75 
 
 		 484 aa  94.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1976  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.53 
 
 		 546 aa  94.4  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175578  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 484 aa  94.4  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 		 556 aa  94  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2336  radical SAM family Fe-S protein  22.25 
 
 		 553 aa  94  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  23.65 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 434 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  24.8 
 
 		 563 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0942  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.49 
 
 		 528 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4901  radical SAM family protein  25.08 
 
 		 474 aa  91.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413487  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1927  cobalamin B12-binding domain protein  27.61 
 
 		 288 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2434  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0114  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.53 
 
 		 609 aa  91.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2566  radical SAM domain-containing protein  25.63 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1668  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.36 
 
 		 612 aa  91.3  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0607785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0797  Radical SAM domain protein  25.19 
 
 		 489 aa  90.9  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1590  Radical SAM domain protein  24.18 
 
 		 488 aa  90.9  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0875  radical SAM family Fe-S protein  27.68 
 
 		 495 aa  90.9  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0710  radical SAM domain-containing protein  20.17 
 
 		 516 aa  90.5  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3504  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  25.95 
 
 		 677 aa  90.5  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1155  radical SAM family protein  27.11 
 
 		 658 aa  90.5  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1481  radical SAM family protein  27.33 
 
 		 644 aa  90.5  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.177835  normal  0.151823 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4087  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 		 458 aa  90.1  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4064  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.81 
 
 		 508 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.416317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2166  radical SAM family Fe-S protein  25.34 
 
 		 495 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2209  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.8 
 
 		 546 aa  89  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.561885  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  27.76 
 
 		 554 aa  89  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2315  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.08 
 
 		 546 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.03087  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0820  Radical SAM domain protein  26.02 
 
 		 583 aa  89  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3553  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 		 474 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 497 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2276  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 642 aa  88.2  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.315011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1584  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.94 
 
 		 527 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0515  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 		 603 aa  88.2  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 474 aa  88.2  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 576 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3570  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 		 658 aa  88.2  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370781  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0229  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.51 
 
 		 547 aa  87.4  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.1 
 
 		 485 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.19 
 
 		 512 aa  87.4  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  29.12 
 
 		 520 aa  87  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 576 aa  87  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>