More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0098 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0098  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 716 aa  1418    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  50.35 
 
 		 705 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1423  radical SAM/B12 binding domain protein  33.85 
 
 		 715 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.623089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2450  radical SAM domain-containing protein  30.91 
 
 		 590 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2521  radical SAM domain-containing protein  32.19 
 
 		 531 aa  171  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0155875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2210  radical SAM domain-containing protein  30.97 
 
 		 565 aa  170  9e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3373  radical SAM domain-containing protein  28.2 
 
 		 503 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0245  radical SAM family protein  29.65 
 
 		 502 aa  135  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000162793  hitchhiker  0.0000142762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2989  Radical SAM domain protein  29.65 
 
 		 500 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2019  Radical SAM domain protein  23.09 
 
 		 525 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0788272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0213  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 		 429 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25181  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4370  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 634 aa  113  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1855  radical SAM family protein  29.03 
 
 		 638 aa  112  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.357803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0105  radical SAM domain-containing protein  30.55 
 
 		 636 aa  105  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0089  Radical SAM domain protein  30.89 
 
 		 643 aa  104  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0070  Radical SAM domain protein  30.19 
 
 		 635 aa  103  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0050  radical SAM domain-containing protein  29.87 
 
 		 707 aa  101  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1420  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 		 632 aa  97.8  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2787  Radical SAM domain protein  28.66 
 
 		 732 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.231637  normal  0.0637853 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  29.26 
 
 		 472 aa  97.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0112  Fe-S oxidoreductase  29.88 
 
 		 726 aa  96.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3570  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 658 aa  97.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370781  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0246  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 		 647 aa  95.5  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1481  radical SAM family protein  26.63 
 
 		 644 aa  94.7  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.177835  normal  0.151823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1155  radical SAM family protein  27.38 
 
 		 658 aa  94.4  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3504  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 		 646 aa  94.4  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3883  radical SAM family protein  28.14 
 
 		 577 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2276  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 642 aa  91.7  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.315011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  31.27 
 
 		 520 aa  89.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  26.27 
 
 		 459 aa  89.4  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3586  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 		 732 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00751133 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3991  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 		 572 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  30 
 
 		 472 aa  89  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1777  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 		 737 aa  87.8  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.54513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2074  radical SAM binding protein  29.64 
 
 		 598 aa  87.4  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  29.88 
 
 		 472 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4030  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 573 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 		 1250 aa  85.1  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 		 529 aa  84.3  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4972  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 738 aa  80.9  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 502 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.2 
 
 		 484 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0033  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 647 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1180  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 647 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1535  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  27.91 
 
 		 651 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  24.85 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3553  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 474 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 461 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0027  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 651 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  27.4 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1460  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 651 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0033  B12-binding/radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 647 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  27.31 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0047  Fe-S oxidoreductase  27.91 
 
 		 647 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.65 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  27.71 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  27.36 
 
 		 460 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0030  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  28 
 
 		 647 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 		 521 aa  75.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1292  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  29.25 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0710  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 516 aa  75.1  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  26.58 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2336  radical SAM family Fe-S protein  25.6 
 
 		 553 aa  74.7  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1125  Fe-S oxidoreductase  25.9 
 
 		 555 aa  74.3  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 524 aa  74.3  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  24.18 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1038  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.7 
 
 		 479 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1009  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.7 
 
 		 479 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  26.35 
 
 		 563 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 		 489 aa  73.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1302  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 540 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0143596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  24.45 
 
 		 533 aa  73.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3422  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 		 541 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  29.76 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0876  radical SAM family Fe-S protein  23.17 
 
 		 461 aa  72  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.74 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  24.69 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  25.42 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  26.27 
 
 		 424 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 469 aa  70.5  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  26.26 
 
 		 426 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3552  Radical SAM domain protein  27.16 
 
 		 488 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0893  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 		 681 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.878222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  25.35 
 
 		 576 aa  68.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0512  Radical SAM domain protein  22.96 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2894  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 613 aa  68.2  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  25.42 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0797  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 489 aa  67.4  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0875  radical SAM family Fe-S protein  27.87 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  25.91 
 
 		 554 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  27.18 
 
 		 564 aa  67  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1165  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 506 aa  67  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3401  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 		 484 aa  66.6  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  27.1 
 
 		 461 aa  66.6  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2062  putative methyltransferase, or Fe-S oxidoreductase  28.57 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6809  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0385  hypothetical protein  28.57 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 		 471 aa  66.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>