More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2450 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2450  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 590 aa  1205    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1423  radical SAM/B12 binding domain protein  33.7 
 
 		 715 aa  299  8e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.623089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0098  radical SAM domain-containing protein  30.91 
 
 		 716 aa  234  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  35.24 
 
 		 705 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2210  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 		 565 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2521  radical SAM domain-containing protein  29.12 
 
 		 531 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0155875  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4370  radical SAM domain-containing protein  30.85 
 
 		 634 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3504  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 		 646 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2019  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 525 aa  158  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0788272  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1481  radical SAM family protein  26.35 
 
 		 644 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.177835  normal  0.151823 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0246  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 647 aa  157  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1420  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 		 632 aa  157  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0070  Radical SAM domain protein  30.06 
 
 		 635 aa  156  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1155  radical SAM family protein  25.69 
 
 		 658 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0105  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 		 636 aa  156  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1855  radical SAM family protein  29.4 
 
 		 638 aa  154  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.357803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0050  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 		 707 aa  154  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0089  Radical SAM domain protein  30.08 
 
 		 643 aa  153  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3570  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 658 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2787  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 732 aa  153  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.231637  normal  0.0637853 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2276  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 642 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.315011  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4972  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 738 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991033  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1777  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 		 737 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.54513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0112  Fe-S oxidoreductase  24.73 
 
 		 726 aa  137  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0245  radical SAM family protein  27.02 
 
 		 502 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000162793  hitchhiker  0.0000142762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3586  Radical SAM domain protein  23.16 
 
 		 732 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00751133 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 459 aa  124  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  28.08 
 
 		 472 aa  124  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3373  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 503 aa  120  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2989  Radical SAM domain protein  29.77 
 
 		 500 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  30.26 
 
 		 529 aa  114  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 470 aa  110  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  27.65 
 
 		 472 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  29 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0213  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 		 429 aa  108  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25181  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  27.02 
 
 		 524 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  30.07 
 
 		 520 aa  107  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 472 aa  104  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 461 aa  101  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  25.77 
 
 		 484 aa  101  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 		 502 aa  100  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 		 473 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1302  Radical SAM domain protein  26.65 
 
 		 540 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0143596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  26.62 
 
 		 563 aa  98.6  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  24.2 
 
 		 471 aa  98.6  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0820  Radical SAM domain protein  31.61 
 
 		 583 aa  98.6  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  28.31 
 
 		 459 aa  97.8  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  28.53 
 
 		 564 aa  97.4  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 		 723 aa  96.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  31.61 
 
 		 576 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  28.34 
 
 		 521 aa  96.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  31.09 
 
 		 576 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 518 aa  95.1  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4090  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 462 aa  94.7  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  22.84 
 
 		 552 aa  94  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0968  Radical SAM domain protein  22.89 
 
 		 630 aa  93.2  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3552  Radical SAM domain protein  29.34 
 
 		 488 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  25.62 
 
 		 554 aa  92.8  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  24.84 
 
 		 473 aa  92.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 		 468 aa  91.3  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 469 aa  91.3  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  22.88 
 
 		 533 aa  91.3  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0030  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  28.61 
 
 		 647 aa  90.5  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1460  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  28.43 
 
 		 651 aa  90.1  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0027  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  28.43 
 
 		 651 aa  90.1  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0033  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  28.43 
 
 		 647 aa  90.1  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1180  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  28.43 
 
 		 647 aa  90.1  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1535  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  28.43 
 
 		 651 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0875  radical SAM family Fe-S protein  27.24 
 
 		 495 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0047  Fe-S oxidoreductase  28.48 
 
 		 647 aa  88.6  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0033  B12-binding/radical SAM domain-containing protein  28.43 
 
 		 647 aa  89  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0512  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 486 aa  89  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 1288 aa  88.6  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1863  radical SAM family protein  25.41 
 
 		 486 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300057  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  23.64 
 
 		 864 aa  87.8  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.56 
 
 		 478 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3422  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 541 aa  87.4  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 426 aa  87  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  24.03 
 
 		 548 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0516  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 501 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  26.84 
 
 		 564 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3504  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  27.97 
 
 		 677 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 528 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.19 
 
 		 484 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 		 487 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  24.06 
 
 		 566 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4087  radical SAM domain-containing protein  30.79 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 441 aa  83.6  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.81 
 
 		 512 aa  83.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.54 
 
 		 674 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2888  B12 binding /radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 503 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  23.31 
 
 		 1250 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  23.56 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  25.92 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  23.36 
 
 		 476 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.69 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  23.41 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  24.36 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 494 aa  80.9  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>