256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1133 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1133  radical SAM family protein  100 
 
 
656 aa  1363    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0262562 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4968  Radical SAM domain protein  38.31 
 
 
652 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4198  radical SAM domain-containing protein  36.35 
 
 
620 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2292  radical SAM domain-containing protein  36.2 
 
 
634 aa  316  8e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727503  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2379  Radical SAM domain protein  31.08 
 
 
623 aa  314  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1863  radical SAM family protein  36.96 
 
 
486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300057  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0968  Radical SAM domain protein  29.64 
 
 
630 aa  295  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1626  Radical SAM domain protein  30.84 
 
 
655 aa  285  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1684  radical SAM family protein  32.98 
 
 
633 aa  278  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198354  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0095  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 
651 aa  269  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1707  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 
646 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 
520 aa  90.1  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 
490 aa  88.6  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1864  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.7 
 
 
565 aa  87.8  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 
488 aa  87  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 
487 aa  87  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 
533 aa  86.7  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2210  radical SAM domain-containing protein  24.01 
 
 
565 aa  85.5  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 
459 aa  84.7  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.51 
 
 
484 aa  84.7  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6339  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.71 
 
 
479 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317674 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  26.5 
 
 
472 aa  82  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3863  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.6 
 
 
580 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582854  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1423  radical SAM/B12 binding domain protein  27.72 
 
 
715 aa  82  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.623089  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7154  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.39 
 
 
479 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535479  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  25.88 
 
 
472 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 
476 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0710  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 
516 aa  78.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2074  radical SAM binding protein  25.34 
 
 
598 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385557  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1625  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.17 
 
 
558 aa  77.8  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  25.61 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  23.15 
 
 
425 aa  77  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1487  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.78 
 
 
567 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 
473 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 
475 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  22.3 
 
 
461 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.45 
 
 
548 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2473  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 
468 aa  75.1  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0785227  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3180  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 
646 aa  74.7  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0030  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  25.15 
 
 
647 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.3 
 
 
476 aa  74.3  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6404  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase 66kD subunit  22.98 
 
 
534 aa  73.9  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3504  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  25.23 
 
 
677 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  27.21 
 
 
556 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 
489 aa  73.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2888  B12 binding /radical SAM domain-containing protein  22.7 
 
 
503 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4090  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 
462 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0047  Fe-S oxidoreductase  23.68 
 
 
647 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 
473 aa  72.8  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 
426 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3654  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.23 
 
 
474 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176133  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1302  Radical SAM domain protein  21.86 
 
 
540 aa  71.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0143596  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2941  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 
625 aa  72  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3812  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.64 
 
 
569 aa  71.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2521  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 
531 aa  71.2  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0155875  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2450  radical SAM domain-containing protein  23.02 
 
 
590 aa  71.2  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3764  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.89 
 
 
474 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.427217  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3455  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.89 
 
 
474 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.207743  normal  0.273738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4778  response regulator receiver protein  23.72 
 
 
675 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0104454 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1535  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  24.27 
 
 
651 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 
564 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1029  Radical SAM domain protein  24.2 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 
474 aa  70.5  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.74 
 
 
478 aa  70.5  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  23.46 
 
 
471 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1668  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.63 
 
 
612 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0607785  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1292  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  29.74 
 
 
474 aa  70.1  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118878  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3553  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 
474 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2336  radical SAM family Fe-S protein  23.88 
 
 
553 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 
518 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0973  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.4 
 
 
477 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.91955  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  24.83 
 
 
475 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 
502 aa  69.7  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.31 
 
 
681 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3231  Radical SAM domain protein  22.97 
 
 
472 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0597  radical SAM family protein  21.88 
 
 
501 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.678652  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0033  B12-binding/radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 
647 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0027  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.68 
 
 
651 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1460  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.68 
 
 
651 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0033  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.68 
 
 
647 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.28 
 
 
512 aa  68.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1180  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.68 
 
 
647 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1014  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.62 
 
 
600 aa  68.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.770044  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  25.17 
 
 
476 aa  68.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3552  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 
488 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 
430 aa  67.8  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1038  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.27 
 
 
479 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20660  MoaA, NifB, PqqE, radical SAM superfamily protein  26.3 
 
 
470 aa  67  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  24.23 
 
 
487 aa  66.6  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1018  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 
504 aa  66.6  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  28.78 
 
 
434 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1009  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.27 
 
 
479 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  24.41 
 
 
476 aa  66.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24 
 
 
674 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.74 
 
 
473 aa  65.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1924  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.48 
 
 
612 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0281  magnesium-protoporphyrin IX monomethylester oxidative cyclase, 66 kDa subunit(bchE)  23.48 
 
 
612 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416035  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3467  Radical SAM domain protein  23.27 
 
 
506 aa  65.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.74 
 
 
473 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>