144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1707 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II1707  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 646 aa  1301    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0968  Radical SAM domain protein  25.16 
 
 		 630 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2379  Radical SAM domain protein  23.79 
 
 		 623 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1626  Radical SAM domain protein  27.82 
 
 		 655 aa  167  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1684  radical SAM family protein  26.74 
 
 		 633 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4198  radical SAM domain-containing protein  26.27 
 
 		 620 aa  159  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2292  radical SAM domain-containing protein  30.69 
 
 		 634 aa  156  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1133  radical SAM family protein  25.47 
 
 		 656 aa  134  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0262562 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1863  radical SAM family protein  26.38 
 
 		 486 aa  127  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300057  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0095  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 		 651 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4968  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 		 652 aa  108  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  28.57 
 
 		 674 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.69 
 
 		 681 aa  72.8  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4090  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2210  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 		 565 aa  70.9  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  25.45 
 
 		 472 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  30.5 
 
 		 554 aa  68.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3504  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  28.25 
 
 		 677 aa  66.6  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0098  radical SAM domain-containing protein  28.71 
 
 		 716 aa  67  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  25.3 
 
 		 548 aa  65.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  25.62 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1302  Radical SAM domain protein  22.87 
 
 		 540 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0143596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  24.77 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  22.43 
 
 		 475 aa  62  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2336  radical SAM family Fe-S protein  23.77 
 
 		 553 aa  62  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2074  radical SAM binding protein  29.93 
 
 		 598 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  22.29 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1125  Fe-S oxidoreductase  26.14 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0229  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  26.06 
 
 		 547 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1423  radical SAM/B12 binding domain protein  25.37 
 
 		 715 aa  58.9  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.623089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 533 aa  58.2  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.76 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  23.62 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1292  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  21.84 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  26.38 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3496  radical SAM family Fe-S protein  25.21 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.256122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  22.7 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.24 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 		 705 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2209  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  26.32 
 
 		 546 aa  57  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.561885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  21.98 
 
 		 475 aa  56.6  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  21.12 
 
 		 476 aa  55.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  20.9 
 
 		 723 aa  55.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  22.22 
 
 		 476 aa  55.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  22.62 
 
 		 497 aa  55.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0738  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  24.59 
 
 		 515 aa  54.3  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.532709  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3863  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.08 
 
 		 580 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582854  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 489 aa  54.3  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0213  radical SAM domain-containing protein  24.42 
 
 		 429 aa  53.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25181  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  24.28 
 
 		 377 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1738  cobalamin B12-binding/radical SAM domain-containing Fe-S oxidoreductase  22.3 
 
 		 521 aa  52.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0251  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.35 
 
 		 546 aa  52.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.42517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.18 
 
 		 484 aa  53.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2158  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.7 
 
 		 546 aa  53.1  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  26.91 
 
 		 609 aa  52.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.35 
 
 		 546 aa  52  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.908643  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0316  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.1 
 
 		 567 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  21.45 
 
 		 494 aa  51.6  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  21.3 
 
 		 494 aa  52  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2019  Radical SAM domain protein  19.66 
 
 		 525 aa  51.6  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0788272  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10215  methyltransferase  27.43 
 
 		 437 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1320  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 435 aa  52  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  25.88 
 
 		 554 aa  51.6  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  20.96 
 
 		 372 aa  51.6  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2941  radical SAM domain-containing protein  28.75 
 
 		 625 aa  51.2  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0780  Radical SAM domain protein  24.5 
 
 		 517 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2315  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.65 
 
 		 546 aa  50.8  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.03087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0488  Radical SAM domain protein  22.1 
 
 		 575 aa  50.8  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3812  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.95 
 
 		 569 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  22.3 
 
 		 475 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1864  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  21.41 
 
 		 565 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 459 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3422  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 		 541 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3764  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  22.22 
 
 		 474 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.427217  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 502 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3455  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  22.22 
 
 		 474 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.207743  normal  0.273738 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0245  radical SAM family protein  23.94 
 
 		 502 aa  48.9  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000162793  hitchhiker  0.0000142762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2687  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  27.38 
 
 		 508 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2062  putative methyltransferase, or Fe-S oxidoreductase  21.9 
 
 		 473 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6809  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0385  hypothetical protein  21.9 
 
 		 473 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2450  radical SAM domain-containing protein  21.71 
 
 		 590 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1735  cobalamin B12-binding domain protein  24.51 
 
 		 590 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0249  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 		 431 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.178286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0434  Radical SAM domain protein  28.22 
 
 		 432 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216188  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1269  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 430 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal  0.258182 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2521  radical SAM domain-containing protein  24.03 
 
 		 531 aa  48.5  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0155875  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.83 
 
 		 512 aa  48.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  22.19 
 
 		 471 aa  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1179  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  21.2 
 
 		 474 aa  48.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.846685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2989  Radical SAM domain protein  21.13 
 
 		 500 aa  48.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1487  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.5 
 
 		 567 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1976  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.26 
 
 		 546 aa  47.8  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175578  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  22.82 
 
 		 529 aa  47.8  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0195  Radical SAM domain protein  29.92 
 
 		 431 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.780626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>