150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_25810 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  96.98 
 
 		 298 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  83.62 
 
 		 297 aa  508  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  71.19 
 
 		 296 aa  427  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  65.76 
 
 		 298 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  61.22 
 
 		 309 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  62.71 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  61.77 
 
 		 295 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  61.77 
 
 		 295 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  62.03 
 
 		 295 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  61.77 
 
 		 295 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  60.68 
 
 		 295 aa  358  5e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  62.21 
 
 		 300 aa  358  7e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  59.39 
 
 		 294 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  60.07 
 
 		 294 aa  348  6e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  61.77 
 
 		 292 aa  345  4e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  59.73 
 
 		 292 aa  345  7e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  54.44 
 
 		 257 aa  275  9e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  40.61 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  37.88 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  40.64 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  40.86 
 
 		 338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  44.73 
 
 		 293 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  39.66 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  41.5 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  43.84 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  35.59 
 
 		 293 aa  193  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  41.72 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  37.88 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  37.95 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  41.07 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000144866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 		 289 aa  186  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  41.73 
 
 		 295 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  37.07 
 
 		 292 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  41.09 
 
 		 293 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  40.07 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  39.67 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3838  radical SAM domain-containing protein  62.94 
 
 		 156 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  35.9 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  38.26 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  35.11 
 
 		 291 aa  155  8e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  38.78 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  35.05 
 
 		 297 aa  152  8e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  32.38 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  34.29 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  30.92 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  31.15 
 
 		 380 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  37.81 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  30.34 
 
 		 388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2061  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.952171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  30.89 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0066  Radical SAM domain protein  29.43 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.628263  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1019  Radical SAM domain protein  32.79 
 
 		 390 aa  122  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0622  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044899  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  30.25 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2640  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.84 
 
 		 296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16730  Fe-S oxidoreductase  31.93 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3579  radical SAM domain-containing protein  33.83 
 
 		 409 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.630491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1372  radical SAM domain-containing protein  31.6 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00660  Fe-S oxidoreductase  32.6 
 
 		 321 aa  95.9  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25380  Fe-S oxidoreductase  28.42 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.76381  normal  0.564969 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3496  hypothetical protein  72.22 
 
 		 38 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.871156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2521  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 		 531 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0155875  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 1288 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 528 aa  56.2  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  30.59 
 
 		 705 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.2 
 
 		 473 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  25.87 
 
 		 459 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.67 
 
 		 473 aa  53.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  29.94 
 
 		 433 aa  52.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2450  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 590 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3552  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 		 488 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 520 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1133  radical SAM family protein  25.93 
 
 		 656 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0262562 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0245  radical SAM family protein  28.3 
 
 		 502 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000162793  hitchhiker  0.0000142762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3370  cobalamin B12-binding  26.48 
 
 		 618 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.818313  normal  0.0333946 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 476 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 		 490 aa  49.3  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0213  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 429 aa  49.3  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25181  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0512  Radical SAM domain protein  22.11 
 
 		 486 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 489 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.04 
 
 		 478 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3373  radical SAM domain-containing protein  23.46 
 
 		 503 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4198  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 		 620 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  24.61 
 
 		 476 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 495 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  25.41 
 
 		 472 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  24.02 
 
 		 472 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  25.58 
 
 		 450 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1038  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.26 
 
 		 479 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1009  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.26 
 
 		 479 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3038  radical SAM family Fe-S protein  29.41 
 
 		 523 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 471 aa  46.6  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4090  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 		 462 aa  46.6  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>