More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1034 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 393 aa  802    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  65.37 
 
 		 398 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  65.27 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  65.01 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  44.22 
 
 		 405 aa  295  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  42.78 
 
 		 369 aa  266  5e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  42.67 
 
 		 369 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  42.01 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  39.45 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  39.43 
 
 		 372 aa  256  5e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  38.24 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  37.56 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  41.86 
 
 		 369 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  36.83 
 
 		 495 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  38.52 
 
 		 378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  41.64 
 
 		 366 aa  232  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  39.53 
 
 		 368 aa  230  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  40.13 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  37.75 
 
 		 360 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  37.23 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 		 410 aa  203  4e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  36.23 
 
 		 412 aa  203  5e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  34.11 
 
 		 372 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  37.6 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 435 aa  106  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  29.18 
 
 		 529 aa  96.7  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  28.12 
 
 		 444 aa  94.4  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  31.55 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 		 470 aa  91.3  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 459 aa  90.5  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 533 aa  89.4  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  26.86 
 
 		 488 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  27.83 
 
 		 489 aa  86.7  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2472  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 507 aa  86.7  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 		 487 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 497 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 528 aa  82  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  24.83 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.89 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  24.86 
 
 		 475 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  23.34 
 
 		 529 aa  80.1  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  21.97 
 
 		 531 aa  79.3  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 		 520 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0972  2-methylthioadenine synthetase  29.68 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 		 521 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  23.63 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2198  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.44 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.972973  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1115  RNA modification protein  29.86 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  25.42 
 
 		 475 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0893  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 681 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.878222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.07 
 
 		 554 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2296  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.99 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00249706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  26.64 
 
 		 501 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0030  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  24.84 
 
 		 647 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 502 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  26.93 
 
 		 562 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10770  tRNA-N(6)-(isopentenyl)adenosine-37 thiotransferase enzyme MiaB  30.54 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.46991  unclonable  0.00000000221813 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.68 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1724  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.38 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2355  RNA modification protein  31.37 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07430  tRNA-N(6)-(isopentenyl)adenosine-37 thiotransferase enzyme MiaB  30.05 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000348325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2129  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.92 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0560251  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  25.32 
 
 		 487 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.29 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0582  hypothetical protein  25.68 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0774  RNA modification enzyme, MiaB family  31.86 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0255462  normal  0.23064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  23.73 
 
 		 529 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0711  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 531 aa  73.6  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.826726  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  23.65 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  25.48 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2210  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.66 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.277896 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  25.48 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2115  RNA modification enzyme, MiaB family  29.67 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.732779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  24.84 
 
 		 723 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1535  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.5 
 
 		 651 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1895  Radical SAM domain protein  23.63 
 
 		 546 aa  72.8  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556208 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 523 aa  72.8  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0047  Fe-S oxidoreductase  22.5 
 
 		 647 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  27.76 
 
 		 436 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0253  2-methylthioadenine synthetase  24.61 
 
 		 444 aa  72.8  0.000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.484105  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  23.79 
 
 		 542 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  23.2 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0027  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.5 
 
 		 651 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  23.63 
 
 		 529 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  24.49 
 
 		 547 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1693  radical SAM family protein  23.76 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  24.84 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0876  radical SAM family Fe-S protein  23.69 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0033  B12-binding/radical SAM domain-containing protein  22.5 
 
 		 647 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0033  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.5 
 
 		 647 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1180  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.5 
 
 		 647 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1460  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.5 
 
 		 651 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0407  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.47 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.39 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>