More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1443 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 410 aa  829    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  73.54 
 
 		 412 aa  619  1e-176  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  74.12 
 
 		 398 aa  608  1e-173  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  70.53 
 
 		 393 aa  588  1e-167  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  38.78 
 
 		 397 aa  209  6e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  38.5 
 
 		 397 aa  207  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  36.39 
 
 		 405 aa  206  7e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  34.2 
 
 		 398 aa  206  7e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 		 393 aa  203  5e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  35.8 
 
 		 371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  37.54 
 
 		 495 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  33.23 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  32.93 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  33.88 
 
 		 369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  31.44 
 
 		 369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  34.07 
 
 		 451 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  36.65 
 
 		 369 aa  173  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  35.9 
 
 		 360 aa  169  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  35.25 
 
 		 378 aa  169  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  34.28 
 
 		 368 aa  169  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  34.25 
 
 		 377 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  34.95 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  34.8 
 
 		 369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  33.76 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  31.16 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  30.1 
 
 		 435 aa  96.7  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  26.78 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 		 562 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  28.11 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 		 497 aa  73.6  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 		 488 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 529 aa  73.2  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  27.71 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  24.28 
 
 		 487 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0783  RNA modification enzyme, MiaB family  30.96 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0101  radical SAM family protein  26.97 
 
 		 624 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00410532  normal  0.882418 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2472  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 507 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 533 aa  68.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3411  coproporphyrinogen III oxidase  30.77 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0878  Radical SAM domain protein  24.74 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000778999  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3801  RNA modification enzyme, MiaB family  27.47 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.920944  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0421  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.92 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  38.74 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1948  coproporphyrinogen III oxidase  30.39 
 
 		 504 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0697  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.14 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2692  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.15 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0545  Coproporphyrinogen dehydrogenase  30.17 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.693751  normal  0.412237 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3355  hypothetical protein  27.85 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.378299  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.94 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  28.25 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 		 567 aa  64.3  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10300  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.45 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2881  coproporphyrinogen III oxidase  29.19 
 
 		 494 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969668  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2199  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.33 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186673  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0468  radical SAM family protein  39.22 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1127  radical SAM family protein  39.22 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5458  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.88 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0531  putative radical SAM protein  39.22 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0454  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.05 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000369122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0512  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  28.04 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  28.33 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  37 
 
 		 316 aa  62.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  27.35 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.92 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0963  RNA modification enzyme, MiaB family  25.3 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 524 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  29.53 
 
 		 317 aa  62  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0094  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  28.16 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 		 551 aa  62  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  24.2 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 		 528 aa  61.2  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  28.57 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3373  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.05 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.1 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0473  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  24.88 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000440615  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7063  coproporphyrinogen III oxidase  30.94 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1341  coproporphyrinogen III oxidase  29.26 
 
 		 505 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.996503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  22.84 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 		 551 aa  60.5  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  22.84 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2173  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.97 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0093  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 		 490 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0584264  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1243  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.9 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  35.64 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4085  Coproporphyrinogen dehydrogenase  28.57 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  23.59 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  33.33 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 521 aa  60.1  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  26.63 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  24.86 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2215  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.25 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.892548  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  39.29 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0858  hypothetical protein  37.78 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0893  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  24.38 
 
 		 474 aa  59.7  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>