252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1457 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 528 aa  1085    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1284  radical SAM domain-containing protein  63.5 
 
 		 530 aa  734    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  59.88 
 
 		 502 aa  626  1e-178  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0336  radical SAM domain-containing protein  29.89 
 
 		 526 aa  240  5.999999999999999e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  30.55 
 
 		 497 aa  238  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 515 aa  229  6e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2083  radical SAM domain-containing protein  30.24 
 
 		 530 aa  225  1e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1955  radical SAM domain-containing protein  30.15 
 
 		 531 aa  223  4e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.684281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2313  radical SAM domain-containing protein  31.59 
 
 		 532 aa  223  6e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.356702  hitchhiker  0.00154549 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 		 497 aa  223  9e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0711  radical SAM domain-containing protein  31.4 
 
 		 531 aa  220  5e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.826726  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1133  Radical SAM domain protein  32.33 
 
 		 531 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0197015  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0065  Radical SAM domain protein  31.16 
 
 		 524 aa  212  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1667  Radical SAM domain protein  30.32 
 
 		 503 aa  200  6e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.26969  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1853  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 548 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1317  radical SAM domain-containing protein  30.79 
 
 		 546 aa  196  8.000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.484061 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1953  radical SAM domain-containing protein  28.97 
 
 		 503 aa  187  4e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1388  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 574 aa  183  8.000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0896  hypothetical protein  25.51 
 
 		 364 aa  95.9  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 398 aa  86.3  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  26.75 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  26.71 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  26.48 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 369 aa  72  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  23.18 
 
 		 372 aa  72  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  23.82 
 
 		 397 aa  72  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  23.55 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  25.09 
 
 		 446 aa  70.1  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 		 397 aa  69.7  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3801  RNA modification enzyme, MiaB family  26.99 
 
 		 445 aa  67  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.920944  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  23.63 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  23.82 
 
 		 495 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 451 aa  62  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 372 aa  62  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  22.62 
 
 		 484 aa  62  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  20.93 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0783  RNA modification enzyme, MiaB family  24.48 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0476614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0278  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0071  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.56 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  22.84 
 
 		 533 aa  58.9  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  21.72 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4256  radical SAM family protein  20.39 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.16 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  24.89 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  19.75 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  23.61 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  24.66 
 
 		 559 aa  57.4  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  19.43 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 544 aa  57  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 544 aa  57  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0796  RNA modification protein  25.87 
 
 		 468 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00700  putative SAM/TRAM family methylase protein  26.42 
 
 		 482 aa  56.6  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 		 523 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0454  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.82 
 
 		 430 aa  55.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000369122  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0935  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  25.25 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000136513  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  23.12 
 
 		 597 aa  55.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  29.18 
 
 		 455 aa  55.1  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1155  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  21.93 
 
 		 427 aa  55.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 		 441 aa  54.7  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  30.56 
 
 		 448 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02230  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.21 
 
 		 477 aa  54.3  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0875  radical SAM family Fe-S protein  26.37 
 
 		 495 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1435  RNA modification protein  22.76 
 
 		 437 aa  54.3  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0959  radical SAM family protein  21.98 
 
 		 530 aa  54.3  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0957  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  25.25 
 
 		 430 aa  53.9  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00162656  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2206  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.05 
 
 		 477 aa  53.9  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163044  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0851  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.63 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.154283  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  24.16 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.77 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0078  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  23.4 
 
 		 435 aa  52.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0535  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  25 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0713  hypothetical protein  20.78 
 
 		 438 aa  52  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 490 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  26.43 
 
 		 476 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3986  RNA modification enzyme, MiaB family  23.51 
 
 		 508 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219223  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1927  cobalamin B12-binding domain protein  25.42 
 
 		 288 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2434  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0042  radical SAM family protein  22.92 
 
 		 502 aa  51.6  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 		 439 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2746  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.86 
 
 		 457 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  21.88 
 
 		 398 aa  51.6  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.86 
 
 		 457 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1850  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.1 
 
 		 481 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 		 428 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 498 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  30.63 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1849  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.39 
 
 		 439 aa  50.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  30.07 
 
 		 504 aa  50.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>