More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1228 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 515 aa  1041    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1667  Radical SAM domain protein  54.77 
 
 		 503 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.26969  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1953  radical SAM domain-containing protein  54.88 
 
 		 503 aa  591  1e-167  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1317  radical SAM domain-containing protein  49.52 
 
 		 546 aa  528  1e-148  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.484061 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1955  radical SAM domain-containing protein  49.52 
 
 		 531 aa  522  1e-147  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.684281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0711  radical SAM domain-containing protein  48.28 
 
 		 531 aa  512  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.826726  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2313  radical SAM domain-containing protein  48.75 
 
 		 532 aa  509  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.356702  hitchhiker  0.00154549 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1133  Radical SAM domain protein  51.42 
 
 		 531 aa  507  9.999999999999999e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0197015  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2083  radical SAM domain-containing protein  48.32 
 
 		 530 aa  503  1e-141  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  38.46 
 
 		 497 aa  298  1e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1853  radical SAM domain-containing protein  31.67 
 
 		 548 aa  230  5e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 		 528 aa  229  6e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  31.99 
 
 		 497 aa  225  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1284  radical SAM domain-containing protein  31.5 
 
 		 530 aa  224  4e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0336  radical SAM domain-containing protein  29.53 
 
 		 526 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0065  Radical SAM domain protein  30.93 
 
 		 524 aa  197  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1388  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 		 574 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  29.71 
 
 		 502 aa  187  4e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 393 aa  72  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  32.04 
 
 		 597 aa  70.1  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  21.75 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  24.49 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 		 1250 aa  67.4  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  21.49 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  24.01 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  24 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  25.09 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  25.61 
 
 		 377 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 484 aa  63.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  23.94 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1757  Radical SAM domain protein  32.65 
 
 		 535 aa  61.2  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0257963  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 600 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1123  RNA modification enzyme, MiaB family  26.94 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58425  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  24.65 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  22.68 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  23.53 
 
 		 563 aa  58.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  23.24 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  22.62 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2935  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.85 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.448542  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  20.49 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0783  RNA modification enzyme, MiaB family  24.01 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  23.88 
 
 		 430 aa  57  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  23.26 
 
 		 557 aa  57  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  23.99 
 
 		 564 aa  57  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0298  RNA modification enzyme, MiaB family  23.4 
 
 		 431 aa  56.6  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0531  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.25 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.280918  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0865  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.06 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.278844  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0021  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.45 
 
 		 473 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0287805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  22.44 
 
 		 438 aa  56.6  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  24.76 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2092  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.24 
 
 		 531 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3387  Radical SAM domain protein  22.34 
 
 		 557 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.18 
 
 		 681 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.21 
 
 		 512 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0774  RNA modification enzyme, MiaB family  24.82 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0255462  normal  0.23064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  26.89 
 
 		 461 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0014  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.86 
 
 		 477 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.0355743 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0968  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.6 
 
 		 454 aa  55.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1216  radical SAM family protein  31.77 
 
 		 679 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.837024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1120  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.58 
 
 		 447 aa  55.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1055  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.44 
 
 		 510 aa  55.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00446  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.42 
 
 		 460 aa  55.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00312623  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0278  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25 
 
 		 443 aa  54.7  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1882  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.16 
 
 		 497 aa  54.7  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0145242  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25 
 
 		 443 aa  54.7  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0476614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3625  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.17 
 
 		 448 aa  54.3  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0208192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 610 aa  53.9  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.2 
 
 		 554 aa  54.3  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3527  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.59 
 
 		 445 aa  53.9  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.70127  normal  0.0537837 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  23.41 
 
 		 422 aa  53.9  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  24.1 
 
 		 451 aa  53.9  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  29.03 
 
 		 428 aa  53.5  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0532  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.01 
 
 		 457 aa  53.5  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.742382 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  24.19 
 
 		 613 aa  53.5  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  30.73 
 
 		 655 aa  53.5  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  28.14 
 
 		 842 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2123  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  25.58 
 
 		 451 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000417118  normal  0.0490217 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  21.67 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0078  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  25.1 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11970  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.32 
 
 		 442 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000060077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0626  RNA modification enzyme, MiaB family  24.83 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.196268  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 369 aa  52.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  27.94 
 
 		 874 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0796  RNA modification protein  24.91 
 
 		 468 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  30.12 
 
 		 554 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  21.85 
 
 		 566 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1349  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.39 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  23.41 
 
 		 397 aa  52.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 512 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 459 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2144  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.09 
 
 		 526 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00154343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0468  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.62 
 
 		 473 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2203  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.57 
 
 		 529 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.117138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>