More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1049 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 398 aa  811    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  65.37 
 
 		 393 aa  539  9.999999999999999e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  63.24 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  62.98 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  40.49 
 
 		 405 aa  277  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  40.16 
 
 		 369 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  40.11 
 
 		 369 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  39.36 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  38.92 
 
 		 371 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 		 495 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  35.85 
 
 		 451 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  37.8 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  37.13 
 
 		 377 aa  243  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  37.98 
 
 		 369 aa  243  5e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  38.5 
 
 		 366 aa  240  4e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  37.63 
 
 		 368 aa  229  5e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  36.73 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  39.76 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  39.83 
 
 		 369 aa  227  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  34.63 
 
 		 372 aa  212  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  35.2 
 
 		 398 aa  207  4e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  34.2 
 
 		 410 aa  206  7e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  35.67 
 
 		 393 aa  206  7e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  34.16 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  27.64 
 
 		 444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  31.53 
 
 		 430 aa  90.5  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 529 aa  87.8  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 		 528 aa  86.3  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  24.17 
 
 		 424 aa  86.3  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  26.48 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 562 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0030  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  25.45 
 
 		 647 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  23.49 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 497 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 441 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1115  RNA modification protein  26.29 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  24.7 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1535  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.74 
 
 		 651 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 		 1250 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.67 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0047  Fe-S oxidoreductase  23.74 
 
 		 647 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0185  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.35 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0027  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.74 
 
 		 651 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1180  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.74 
 
 		 647 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1460  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.74 
 
 		 651 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0033  B12-binding/radical SAM domain-containing protein  23.74 
 
 		 647 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0033  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.74 
 
 		 647 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.4 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  27.2 
 
 		 438 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  26.81 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 		 551 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  24.75 
 
 		 533 aa  78.2  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.82 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  22.51 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 		 551 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  23.19 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2472  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 		 507 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1849  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.36 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218308  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0258  conserved hypothetical protein, radical SAM domain family (UPF0004 domain protein)  28.06 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  21.65 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2935  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.72 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.448542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2387  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.18 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.844507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1630  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  30.73 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0566409  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  24.76 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0180  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.81 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 897 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0983  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  30.18 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000730864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1205  RNA modification protein  29.41 
 
 		 595 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00267373  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2334  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  27.83 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3625  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.82 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0208192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.36 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.33 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2198  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.38 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.972973  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  25.16 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1018  RNA modification enzyme, MiaB family  29.5 
 
 		 449 aa  73.2  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.657516  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0019  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.91 
 
 		 469 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.43689 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 723 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0774  RNA modification enzyme, MiaB family  30.47 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0255462  normal  0.23064 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1214  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.09 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193659  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2374  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.1 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.997714 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0031  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.97 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  24.25 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0876  radical SAM family Fe-S protein  22.81 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2153  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.58 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1125  Fe-S oxidoreductase  24.78 
 
 		 555 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  25.43 
 
 		 609 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  25.33 
 
 		 489 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2066  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.58 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0928241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1435  RNA modification protein  25.33 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0512  Radical SAM domain protein  33.63 
 
 		 486 aa  72  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  25.91 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07430  tRNA-N(6)-(isopentenyl)adenosine-37 thiotransferase enzyme MiaB  27.78 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000348325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1724  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.99 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  23 
 
 		 531 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 		 898 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>