More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0228 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  73.06 
 
 
438 aa  677    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  93.2 
 
 
441 aa  847    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  93.59 
 
 
437 aa  833    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
441 aa  893    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  62.9 
 
 
455 aa  553  1e-156  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  49.43 
 
 
430 aa  449  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  46.22 
 
 
435 aa  422  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  44.19 
 
 
444 aa  389  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  28.92 
 
 
450 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.27 
 
 
473 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 
471 aa  93.2  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.43 
 
 
473 aa  93.6  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  26.26 
 
 
564 aa  93.6  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
1250 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  30.28 
 
 
425 aa  91.3  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 
476 aa  91.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 
444 aa  89  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 
393 aa  89  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3625  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.92 
 
 
448 aa  87.4  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0208192  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 
490 aa  87.4  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 
473 aa  87  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2935  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.32 
 
 
448 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.448542  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  24.7 
 
 
564 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 
518 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  25.46 
 
 
533 aa  85.1  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  30.66 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  23.96 
 
 
473 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  28.88 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  28.2 
 
 
488 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.09 
 
 
441 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0675  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  31.09 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00122823  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 
495 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3300  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.75 
 
 
454 aa  84  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.170936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1515  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.68 
 
 
442 aa  84  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.561512  normal  0.183018 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2909  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  24.41 
 
 
451 aa  83.6  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0875  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.53 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633872  normal  0.103821 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 
489 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4087  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 
458 aa  83.6  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  22.54 
 
 
476 aa  83.6  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3231  Radical SAM domain protein  26.12 
 
 
472 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0968  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.08 
 
 
454 aa  83.2  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1029  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 
472 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 
576 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  26.16 
 
 
563 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  24.75 
 
 
472 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 
433 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0242  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.56 
 
 
473 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.3 
 
 
437 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  25.18 
 
 
474 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02230  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.63 
 
 
477 aa  82.4  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2153  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.86 
 
 
467 aa  81.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  27 
 
 
444 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000242644  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  28.28 
 
 
476 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2066  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.86 
 
 
467 aa  81.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0928241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 
441 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0408  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.43 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 
428 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  24.53 
 
 
520 aa  80.5  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 
475 aa  80.9  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1184  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  26.64 
 
 
482 aa  80.5  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0758  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.86 
 
 
462 aa  80.5  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0030  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  29.47 
 
 
647 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 
576 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  31 
 
 
548 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 
487 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2334  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  28.85 
 
 
459 aa  80.1  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.84 
 
 
476 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0394  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  26.03 
 
 
508 aa  79.7  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.73924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 
497 aa  79.7  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0423  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25 
 
 
456 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.502734  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1180  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  30.11 
 
 
647 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0047  Fe-S oxidoreductase  30.11 
 
 
647 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1115  RNA modification protein  30.43 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1535  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  30.11 
 
 
651 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0596  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.12 
 
 
451 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3373  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.93 
 
 
447 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1120  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.16 
 
 
447 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0748  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.12 
 
 
451 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000201593 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0033  B12-binding/radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 
647 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0033  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  30.11 
 
 
647 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 
461 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  25.6 
 
 
475 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0963  RNA modification enzyme, MiaB family  27 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 
451 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4804  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  26.13 
 
 
442 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.557764  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0027  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  30.11 
 
 
651 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0208  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.81 
 
 
449 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20660  MoaA, NifB, PqqE, radical SAM superfamily protein  27.92 
 
 
470 aa  78.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1721  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.85 
 
 
450 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.081167  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  23.78 
 
 
360 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3617  RNA modification protein  25 
 
 
467 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0468  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.62 
 
 
473 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1460  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  30.11 
 
 
651 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 
528 aa  78.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0532  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.08 
 
 
457 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.742382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>