More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1323 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 360 aa  738    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  60.67 
 
 		 369 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  58.94 
 
 		 369 aa  435  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  53.59 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  52.35 
 
 		 372 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  43.82 
 
 		 377 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  44.38 
 
 		 371 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  41.78 
 
 		 368 aa  264  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  40.06 
 
 		 369 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  40.96 
 
 		 369 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  40.06 
 
 		 369 aa  256  6e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  42.76 
 
 		 378 aa  246  4e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  39.76 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  37.75 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  36.9 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  42.5 
 
 		 495 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  34.72 
 
 		 397 aa  192  9e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  40.66 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  37.21 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  35.9 
 
 		 410 aa  169  5e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 393 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  33.92 
 
 		 412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  34.2 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  28.49 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 		 435 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 562 aa  93.6  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  28.9 
 
 		 554 aa  91.3  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1693  radical SAM family protein  29.28 
 
 		 467 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 		 487 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  29.62 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  28.09 
 
 		 460 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  26.62 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2198  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.96 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.972973  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  30.06 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  26.32 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  27.64 
 
 		 563 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 		 1250 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0678  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  28.77 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000258003  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1724  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.41 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1735  cobalamin B12-binding domain protein  28.1 
 
 		 590 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1436  radical SAM domain-containing protein  29.45 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.37868  decreased coverage  0.00181566 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05330  Fe-S oxidoreductase  28.39 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3399  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.54 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.497739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0452  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.04 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  29.01 
 
 		 556 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  30.67 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  23.01 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.17 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2296  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.86 
 
 		 441 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00249706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  25.84 
 
 		 434 aa  72.8  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  25.61 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0840  cobalamin B12-binding domain protein  27.04 
 
 		 590 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2074  radical SAM binding protein  29.59 
 
 		 598 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2129  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.34 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0560251  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 		 498 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  27.15 
 
 		 564 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  25.59 
 
 		 520 aa  72  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3528  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.57 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3204  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.88 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  29.8 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 529 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2472  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 		 507 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.12 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1243  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.28 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.21 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0710  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 516 aa  70.5  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0273  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 		 589 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3533  Radical SAM domain protein  27.8 
 
 		 506 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 528 aa  70.1  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  23.42 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  22.69 
 
 		 461 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  23.36 
 
 		 509 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  24.76 
 
 		 433 aa  69.3  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  26.93 
 
 		 520 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0235  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.08 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1897  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 483 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.487619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3182  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.17 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155931  normal  0.0201229 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  23.59 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1298  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 600 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2352  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.1 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0014  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.93 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.0355743 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  26.28 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0590  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.15 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.632056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3556  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0876  radical SAM family Fe-S protein  27.51 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0758  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.57 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  23.18 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2355  RNA modification protein  29.53 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>