More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1897 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1195  radical SAM domain-containing protein  76.36 
 
 
478 aa  738    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1436  radical SAM domain-containing protein  65.97 
 
 
476 aa  675    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.37868  decreased coverage  0.00181566 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0304  radical SAM domain-containing protein  65.07 
 
 
483 aa  642    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1897  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
483 aa  982    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.487619  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0457  radical SAM domain-containing protein  35.93 
 
 
519 aa  236  8e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.211287  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  30.86 
 
 
551 aa  206  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 
599 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  31.89 
 
 
544 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 
599 aa  200  6e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 
563 aa  199  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  29.76 
 
 
589 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  29.57 
 
 
589 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  30.09 
 
 
849 aa  196  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  31.93 
 
 
566 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  31.77 
 
 
557 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 
557 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3062  radical SAM domain-containing protein  30.89 
 
 
563 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.477497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  29.39 
 
 
589 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  32.38 
 
 
559 aa  192  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  29.77 
 
 
613 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  31.24 
 
 
544 aa  190  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 
613 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  32.03 
 
 
545 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  29.87 
 
 
593 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  27.72 
 
 
618 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  27.99 
 
 
619 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  30.16 
 
 
600 aa  179  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1159  radical SAM family protein  28.18 
 
 
510 aa  179  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044499  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  29.14 
 
 
557 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  30.57 
 
 
573 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.25 
 
 
546 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  29.3 
 
 
812 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  28.67 
 
 
828 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  29.46 
 
 
842 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 
657 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  29.71 
 
 
597 aa  174  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  28.55 
 
 
842 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 
617 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  27.29 
 
 
836 aa  171  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0161  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 
469 aa  170  5e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2669  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.08 
 
 
528 aa  170  6e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0247408  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  28.9 
 
 
540 aa  169  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  28.44 
 
 
538 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  27.69 
 
 
626 aa  168  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 
626 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  27.01 
 
 
613 aa  167  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  29.5 
 
 
817 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  26.92 
 
 
544 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3383  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 
645 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.660882  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 
624 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  27.94 
 
 
611 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 
828 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 
826 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.35 
 
 
860 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 
864 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  27.47 
 
 
828 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  28.72 
 
 
619 aa  162  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0978  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 
600 aa  161  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0239  Beta tubulin, autoregulation binding site  26.09 
 
 
897 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0547979 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  27.53 
 
 
627 aa  161  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 
614 aa  161  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1216  radical SAM family protein  27.97 
 
 
679 aa  160  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.837024  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4678  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 
543 aa  160  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5264  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 
677 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06130  Fe-S oxidoreductase  27.11 
 
 
626 aa  159  8e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000171239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7274  Fe-S oxidoreductase  26.06 
 
 
636 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.867612  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2601  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 
553 aa  158  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2388  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 
617 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.938561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2100  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 
617 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30001  Fe-S oxidoreductase  26.54 
 
 
532 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1544  Radical SAM domain protein  28.83 
 
 
640 aa  158  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496911  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0179  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 
591 aa  158  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.11642  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.03 
 
 
894 aa  157  4e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  26.92 
 
 
971 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  26.32 
 
 
910 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3459  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 
663 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525782  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3436  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 
537 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000587564 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 
897 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1585  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 
642 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458582  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2185  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.2 
 
 
644 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.972123  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 
860 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7280  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 
645 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  27.42 
 
 
638 aa  155  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0375  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 
438 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0386229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  24.83 
 
 
879 aa  153  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4437  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 
537 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.07608 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14180  Fe-S oxidoreductase  26.77 
 
 
626 aa  153  5.9999999999999996e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4375  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 
537 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0753  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
654 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1544  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 
438 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  26.36 
 
 
882 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  24.04 
 
 
633 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  25.09 
 
 
856 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 
922 aa  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  25.09 
 
 
857 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3484  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 
663 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3787  Radical SAM domain protein  31.22 
 
 
525 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182556  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  27.47 
 
 
852 aa  150  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3863  radical SAM domain-containing protein  27.09 
 
 
661 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.721561  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0461  radical SAM domain-containing protein  28.79 
 
 
438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>