More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0595 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  73.74 
 
 		 438 aa  686    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  91.76 
 
 		 441 aa  830    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 437 aa  886    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  93.59 
 
 		 441 aa  833    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  62.44 
 
 		 455 aa  553  1e-156  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  50.11 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  46 
 
 		 435 aa  420  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  44.42 
 
 		 444 aa  387  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 		 564 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  31.71 
 
 		 459 aa  98.2  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 		 1250 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  28.68 
 
 		 450 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  30.14 
 
 		 425 aa  93.2  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  23.41 
 
 		 471 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4087  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 		 458 aa  90.9  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 473 aa  90.5  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.25 
 
 		 473 aa  90.1  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 564 aa  90.1  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 		 490 aa  89.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  28.03 
 
 		 473 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.45 
 
 		 441 aa  88.2  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 476 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 473 aa  87.4  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  31.02 
 
 		 405 aa  87.4  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 518 aa  87  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 444 aa  86.7  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 488 aa  86.7  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0875  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.94 
 
 		 449 aa  86.7  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633872  normal  0.103821 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  26.62 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3625  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27 
 
 		 448 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0208192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1721  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.42 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.081167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3300  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.18 
 
 		 454 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.170936 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  28.19 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2909  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  28.44 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2935  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.42 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.448542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  22.85 
 
 		 528 aa  84.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 		 576 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  29.54 
 
 		 548 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1515  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.33 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.561512  normal  0.183018 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 		 520 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0968  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.25 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.61 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  25 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3373  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  24.51 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0046  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.954512 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  27.33 
 
 		 563 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 		 520 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 495 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02230  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.23 
 
 		 477 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0675  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  30.57 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00122823  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0408  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.34 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  25.41 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 576 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 497 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4345  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.66 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0597  radical SAM family protein  24.47 
 
 		 501 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.678652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  24.85 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1120  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.64 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  24.11 
 
 		 533 aa  80.9  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.53 
 
 		 554 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.14 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0423  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.89 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.502734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1029  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1184  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  27.57 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  24.42 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2334  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  28.5 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  23.82 
 
 		 476 aa  80.1  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  26.81 
 
 		 398 aa  79.7  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0316  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.59 
 
 		 567 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3231  Radical SAM domain protein  24.57 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 468 aa  79.7  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 		 475 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2888  B12 binding /radical SAM domain-containing protein  22.93 
 
 		 503 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 552 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0963  RNA modification enzyme, MiaB family  28.71 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4804  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  27.35 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.557764  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0030  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  28.99 
 
 		 647 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2074  radical SAM binding protein  26.69 
 
 		 598 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0468  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.91 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  24.58 
 
 		 556 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  25.89 
 
 		 475 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0531  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.55 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.280918  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1536  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  29.46 
 
 		 525 aa  78.2  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262193 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  24.83 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1715  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  29.46 
 
 		 531 aa  78.2  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1115  RNA modification protein  29.89 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0748  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.37 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000201593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  24.78 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>