More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0661 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 438 aa  890    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  73.06 
 
 		 441 aa  677    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  72.6 
 
 		 441 aa  681    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  73.74 
 
 		 437 aa  686    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  58.69 
 
 		 455 aa  531  1e-150  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  47.95 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  44.75 
 
 		 435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  42.5 
 
 		 444 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  29.45 
 
 		 369 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 533 aa  98.2  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  28.25 
 
 		 488 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  28.92 
 
 		 369 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 		 459 aa  94  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 		 487 aa  93.6  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.72 
 
 		 473 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  28.37 
 
 		 425 aa  92  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 520 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 		 476 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 		 450 aa  90.9  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 564 aa  90.9  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 		 468 aa  90.1  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  29.62 
 
 		 433 aa  90.1  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.16 
 
 		 473 aa  89.7  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3339  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 555 aa  89.7  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  24.27 
 
 		 473 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 		 490 aa  89.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3231  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 472 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  28.23 
 
 		 563 aa  87.4  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  25.87 
 
 		 723 aa  87  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0963  RNA modification enzyme, MiaB family  28.57 
 
 		 432 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  25.41 
 
 		 475 aa  86.7  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 		 470 aa  86.7  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  24.86 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  26.27 
 
 		 489 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 556 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1029  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 475 aa  84  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 451 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 473 aa  83.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 		 1250 aa  83.6  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.33 
 
 		 554 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  23.85 
 
 		 472 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3919  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.87 
 
 		 475 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1125  Fe-S oxidoreductase  24.2 
 
 		 555 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3617  RNA modification protein  27.8 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  26.64 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3625  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.83 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0208192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  25.8 
 
 		 552 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2935  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.83 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.448542  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.56 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1074  hypothetical protein  25.4 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 497 aa  79.7  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4804  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  26.87 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.557764  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  26.4 
 
 		 564 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2909  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  25.79 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1009  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  28.44 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1515  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.25 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.561512  normal  0.183018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1427  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  29.53 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0581575  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1038  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  28.44 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  27.2 
 
 		 398 aa  79.7  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0408  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.89 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0584  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.53 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3300  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.57 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.170936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0875  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.88 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633872  normal  0.103821 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1047  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.05 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000312807  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0596  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.48 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  23.35 
 
 		 502 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0940  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.52 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.481544 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3373  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.25 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0748  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.48 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000201593 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  26.98 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000242644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4087  radical SAM domain-containing protein  24.16 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.01 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  23.64 
 
 		 528 aa  77.8  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0531  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.41 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.280918  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  24.49 
 
 		 518 aa  77  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2129  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.67 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0560251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 576 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0437  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.63 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0423  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.57 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.502734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3572  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.63 
 
 		 480 aa  76.3  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  28.62 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  24.61 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  22.78 
 
 		 509 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 500 aa  75.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0516  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 501 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 529 aa  75.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1120  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.83 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>