More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1062 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
372 aa  762    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  79.29 
 
 
369 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  78.65 
 
 
369 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  77.84 
 
 
369 aa  600  1e-170  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  61.17 
 
 
378 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  44.44 
 
 
377 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  44.41 
 
 
368 aa  300  2e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  41.02 
 
 
371 aa  291  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  43.81 
 
 
369 aa  285  7e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  41.62 
 
 
366 aa  270  2e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  40.75 
 
 
369 aa  258  9e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  40 
 
 
360 aa  257  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  39.43 
 
 
393 aa  256  5e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  42.77 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  36.9 
 
 
372 aa  252  7e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  37.8 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  36.29 
 
 
495 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  38.42 
 
 
397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  38.16 
 
 
397 aa  223  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  34.46 
 
 
451 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  33.23 
 
 
410 aa  187  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  30.37 
 
 
393 aa  181  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  31.97 
 
 
398 aa  171  3e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  32.79 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 
435 aa  99.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  28.69 
 
 
430 aa  89.4  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  24.92 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 
438 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  27.21 
 
 
459 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  25.64 
 
 
444 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000242644  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 
470 aa  85.5  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0756  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.54 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 
529 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  24.27 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0065  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  26.59 
 
 
451 aa  81.6  0.00000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  22.34 
 
 
529 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  26.89 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0071  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.21 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 
461 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1693  radical SAM family protein  23.16 
 
 
467 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 
455 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  21.43 
 
 
529 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0535  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  26.38 
 
 
473 aa  79  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  22.06 
 
 
527 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 
461 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  26.97 
 
 
533 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
1250 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1724  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.42 
 
 
440 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  23.34 
 
 
518 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2948  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  26.4 
 
 
476 aa  76.3  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0824  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.85 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0715  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.85 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0188507  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1701  radical SAM family protein  21.99 
 
 
469 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00126936  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0776  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.85 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.410569  normal  0.687788 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 
533 aa  75.5  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0729  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.85 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 
434 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0788  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.85 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00629  isopentenyl-adenosine A37 tRNA methylthiolase  27.48 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.194806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2965  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  27.48 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00048321  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0586  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.53 
 
 
474 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0067501  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0684  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.48 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00591488  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02230  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.38 
 
 
477 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 
460 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0755  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.48 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00437825  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3134  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  26.63 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0690  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.48 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1197  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  26.63 
 
 
474 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02988  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2984  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.48 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0263155  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00620  hypothetical protein  27.48 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0708  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.48 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000784837  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  27.25 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2206  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.77 
 
 
477 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163044  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1155  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.54 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0408  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.07 
 
 
456 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  21.03 
 
 
529 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0423  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.07 
 
 
456 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.502734  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2139  RNA modification enzyme, MiaB family  24.04 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  22.65 
 
 
433 aa  73.2  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0972  2-methylthioadenine synthetase  26.1 
 
 
445 aa  73.2  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  22.89 
 
 
522 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 
488 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1849  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.37 
 
 
439 aa  72.4  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218308  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2355  MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.24 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 
497 aa  72.8  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 
487 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2198  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.19 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.972973  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1563  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.72 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.739198  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  23.42 
 
 
480 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  26.04 
 
 
459 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3300  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.43 
 
 
454 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.170936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0584  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.09 
 
 
469 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  28.47 
 
 
529 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  23.96 
 
 
533 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1187  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.5 
 
 
474 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0370787  normal  0.0145115 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3572  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.31 
 
 
480 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3779  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.38 
 
 
459 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187092 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2909  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  24.52 
 
 
451 aa  71.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>