More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1169 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  100 
 
 		 372 aa  762    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  52.82 
 
 		 369 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  51.48 
 
 		 369 aa  391  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  52.35 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  51.5 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  40.91 
 
 		 377 aa  269  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  40.3 
 
 		 369 aa  259  4e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  40.6 
 
 		 369 aa  255  8e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  36.9 
 
 		 372 aa  252  7e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  40.3 
 
 		 369 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  39.78 
 
 		 368 aa  250  4e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  40.24 
 
 		 371 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  38.28 
 
 		 378 aa  216  5e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  34.63 
 
 		 398 aa  212  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  37.99 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  39.51 
 
 		 495 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  34.11 
 
 		 393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  36.52 
 
 		 397 aa  186  7e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  35.94 
 
 		 397 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  35.47 
 
 		 451 aa  169  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  34.95 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 		 398 aa  160  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  33.75 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  33.65 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  30.65 
 
 		 435 aa  97.1  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  29.52 
 
 		 430 aa  93.6  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 		 470 aa  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.03 
 
 		 434 aa  90.9  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 562 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  28.06 
 
 		 434 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 450 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 		 723 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  26.74 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.04 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.24 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2355  RNA modification protein  26.27 
 
 		 466 aa  84  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  28.15 
 
 		 520 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0590  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.12 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.632056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0468  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.03 
 
 		 473 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0021  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.23 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0287805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  23.4 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.35 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  27.38 
 
 		 554 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0783  RNA modification enzyme, MiaB family  29.25 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.9 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2004  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.91 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.460687  normal  0.201882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2909  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  26.01 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 533 aa  77.8  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  26.14 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1793  RNA modification enzyme, MiaB family  28.4 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 		 529 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2352  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.18 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0818  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.83 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.069148  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1436  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.37868  decreased coverage  0.00181566 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.91 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2296  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.16 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00249706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  28.52 
 
 		 447 aa  76.3  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  24.9 
 
 		 468 aa  76.3  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  24.03 
 
 		 461 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.17 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  22.06 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10770  tRNA-N(6)-(isopentenyl)adenosine-37 thiotransferase enzyme MiaB  31.07 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.46991  unclonable  0.00000000221813 
 
 
-
 
NC_002950  PG1012  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.92 
 
 		 463 aa  75.1  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  26.45 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  26.45 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1746  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.33 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  25.81 
 
 		 518 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3911  RNA modification enzyme, MiaB family  26.96 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.5 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0304  radical SAM domain-containing protein  24.13 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  25.16 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 557 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  25.09 
 
 		 459 aa  73.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1318  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.45 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0596  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.37 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0748  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.37 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000201593 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  25.82 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2198  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.13 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.972973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  25.82 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  25.82 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  25.82 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0014  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.43 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.0355743 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0940  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.29 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.481544 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  25.82 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0697  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.19 
 
 		 462 aa  73.6  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.224906 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1349  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.7 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  25.82 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0774  RNA modification enzyme, MiaB family  29.61 
 
 		 455 aa  73.2  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0255462  normal  0.23064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3387  Radical SAM domain protein  25.33 
 
 		 557 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  25.82 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  25.82 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25 
 
 		 429 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.08 
 
 		 441 aa  72.8  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1156  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.7 
 
 		 447 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.516492  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0452  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.8 
 
 		 463 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0242  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.43 
 
 		 473 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2207  RNA modification enzyme, MiaB family  28.69 
 
 		 440 aa  72.8  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>