More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0097 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 		 434 aa  879    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  93.55 
 
 		 434 aa  834    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  50.24 
 
 		 421 aa  415  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  48.94 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  38.89 
 
 		 434 aa  301  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.12 
 
 		 438 aa  301  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  37.21 
 
 		 434 aa  292  7e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.01 
 
 		 450 aa  290  3e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  36.79 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.22 
 
 		 449 aa  286  5e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0180  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.94 
 
 		 434 aa  284  3.0000000000000004e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  35.68 
 
 		 454 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.29 
 
 		 471 aa  279  7e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  37.2 
 
 		 449 aa  279  9e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.63 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  37.25 
 
 		 446 aa  277  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  37.14 
 
 		 448 aa  276  5e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  37.14 
 
 		 448 aa  276  5e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  36.76 
 
 		 448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  37.97 
 
 		 451 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.65 
 
 		 442 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_835  tRNA modification enzyme, MiaB family  36.77 
 
 		 416 aa  272  7e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.258618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.01 
 
 		 429 aa  272  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.65 
 
 		 434 aa  270  4e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.65 
 
 		 434 aa  270  4e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.04 
 
 		 417 aa  269  8.999999999999999e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1711  hypothetical protein  37.47 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  36.82 
 
 		 437 aa  268  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  37.47 
 
 		 450 aa  266  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.18 
 
 		 441 aa  265  8e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.01 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  36.48 
 
 		 439 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  36.79 
 
 		 435 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  36.98 
 
 		 450 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  36.08 
 
 		 450 aa  262  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  36.08 
 
 		 450 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  36.08 
 
 		 450 aa  262  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  36.08 
 
 		 450 aa  262  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.58 
 
 		 429 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.34 
 
 		 431 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  36.08 
 
 		 450 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  36.74 
 
 		 450 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  36.08 
 
 		 450 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  36.74 
 
 		 450 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  36.74 
 
 		 450 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  37.56 
 
 		 431 aa  260  3e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.26 
 
 		 441 aa  259  7e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0962  MiaB family tRNA modification protein  35.7 
 
 		 413 aa  258  1e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.59 
 
 		 432 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0853  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.45 
 
 		 416 aa  258  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.5 
 
 		 435 aa  256  7e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.71 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.23 
 
 		 425 aa  254  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.62 
 
 		 420 aa  250  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1933  hypothetical protein  36.02 
 
 		 427 aa  249  6e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1860  hypothetical protein  36.02 
 
 		 427 aa  249  6e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.17951  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.03 
 
 		 439 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.42 
 
 		 438 aa  248  1e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.39 
 
 		 466 aa  247  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1414  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.44 
 
 		 420 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.88 
 
 		 450 aa  247  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0926  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.27 
 
 		 427 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.084888  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0503  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.8 
 
 		 408 aa  245  9e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3405  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.49 
 
 		 435 aa  243  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1849  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.89 
 
 		 433 aa  243  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.922054 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.56 
 
 		 444 aa  243  7e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6072  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.12 
 
 		 449 aa  242  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0928741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07660  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.47 
 
 		 409 aa  241  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.738464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  36.21 
 
 		 440 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3390  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.21 
 
 		 426 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27690  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.57 
 
 		 494 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  34.88 
 
 		 438 aa  240  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0444  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.71 
 
 		 442 aa  239  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09066  putative Fe-S oxidoreductase  33.87 
 
 		 458 aa  236  5.0000000000000005e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276137  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  33.18 
 
 		 441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_002950  PG2221  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.39 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000670309 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  33.26 
 
 		 480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2207  RNA modification enzyme, MiaB family  32.5 
 
 		 440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  34.38 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1294  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.6 
 
 		 409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0319  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.09 
 
 		 419 aa  233  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2810  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.29 
 
 		 421 aa  233  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1044  RNA modification enzyme, MiaB family  34.26 
 
 		 534 aa  233  6e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.852588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.52 
 
 		 456 aa  232  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000454579  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0976  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.02 
 
 		 467 aa  232  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.29 
 
 		 471 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  32.18 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0214  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.18 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0176423 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19921  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.62 
 
 		 480 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.135238 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0549  RNA modification protein  33.85 
 
 		 443 aa  229  6e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3229  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.92 
 
 		 416 aa  229  9e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0152656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4866  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.25 
 
 		 449 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2852  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.36 
 
 		 444 aa  229  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2004  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.76 
 
 		 476 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.460687  normal  0.201882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3911  RNA modification enzyme, MiaB family  33.16 
 
 		 483 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2497  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.58 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0715823  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3092  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.55 
 
 		 424 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.852601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0586  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.46 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0067501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0708  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.99 
 
 		 474 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000784837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.73 
 
 		 495 aa  227  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.496163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>