More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1333 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 		 449 aa  919    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  58.8 
 
 		 434 aa  545  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  54.04 
 
 		 454 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  51.74 
 
 		 434 aa  473  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  51.74 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  51.74 
 
 		 434 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  47.93 
 
 		 436 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  50.71 
 
 		 451 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  48.93 
 
 		 450 aa  428  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  49.17 
 
 		 450 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  48.22 
 
 		 450 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  48.93 
 
 		 450 aa  428  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  49.17 
 
 		 450 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  48.93 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  48.45 
 
 		 449 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  48.93 
 
 		 450 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  48.93 
 
 		 450 aa  428  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  48.93 
 
 		 450 aa  428  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  48.93 
 
 		 450 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  48.69 
 
 		 450 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  49.08 
 
 		 435 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  47.7 
 
 		 448 aa  418  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  47 
 
 		 448 aa  415  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  48.34 
 
 		 466 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  47 
 
 		 448 aa  415  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  49.77 
 
 		 431 aa  414  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  45.58 
 
 		 450 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.34 
 
 		 438 aa  395  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.44 
 
 		 450 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  46.77 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  47.82 
 
 		 439 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  44.55 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.77 
 
 		 456 aa  345  8e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000454579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  41.31 
 
 		 446 aa  341  1e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.74 
 
 		 435 aa  338  1.9999999999999998e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  38.71 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.79 
 
 		 429 aa  335  9e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.45 
 
 		 442 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.11 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.19 
 
 		 444 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.95 
 
 		 438 aa  332  7.000000000000001e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.72 
 
 		 431 aa  331  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.12 
 
 		 434 aa  330  4e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.87 
 
 		 432 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.88 
 
 		 427 aa  323  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.88 
 
 		 430 aa  321  9.999999999999999e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.41 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.84 
 
 		 444 aa  320  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09066  putative Fe-S oxidoreductase  40.64 
 
 		 458 aa  317  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276137  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1350  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.96 
 
 		 449 aa  316  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  39.13 
 
 		 438 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  38.13 
 
 		 440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.78 
 
 		 417 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.37 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0444  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.22 
 
 		 442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.25 
 
 		 429 aa  298  2e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.67 
 
 		 425 aa  293  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2207  RNA modification enzyme, MiaB family  36.14 
 
 		 440 aa  289  8e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1711  hypothetical protein  37.2 
 
 		 436 aa  288  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.22 
 
 		 434 aa  286  5e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.37 
 
 		 495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.496163 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.15 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  34.67 
 
 		 447 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0422  RNA modification protein  36.49 
 
 		 446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0536856  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.41 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11680  RNA modification enzyme, MiaB family  36.34 
 
 		 450 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0952269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  37.92 
 
 		 451 aa  277  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3037  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.25 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  34.83 
 
 		 444 aa  275  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000242644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0795  RNA modification enzyme, MiaB family  37.56 
 
 		 423 aa  273  5.000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.134555  normal  0.773593 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.63 
 
 		 471 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0352  RNA modification enzyme, MiaB family  34.39 
 
 		 458 aa  271  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.135679  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1728  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.62 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.479022  decreased coverage  0.00502843 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1996  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35 
 
 		 451 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1790  RNA modification enzyme, MiaB family  36.32 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0115132  normal  0.0236064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3787  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.26 
 
 		 446 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.453305  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.35 
 
 		 421 aa  269  7e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2374  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.29 
 
 		 452 aa  269  8e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.997714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3288  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.51 
 
 		 451 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0566  hypothetical protein  35.56 
 
 		 470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.59061  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2835  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.28 
 
 		 446 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1560  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.19 
 
 		 411 aa  266  8e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0106  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.56 
 
 		 454 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.027127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6072  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.48 
 
 		 449 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0928741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0377  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.81 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0849  RNA modification enzyme, MiaB family  32.13 
 
 		 458 aa  265  1e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2221  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.9 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000670309 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_835  tRNA modification enzyme, MiaB family  34.95 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.258618  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4999  MiaB family RNA modification protein  33.03 
 
 		 453 aa  263  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0459  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.3 
 
 		 453 aa  263  6e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.240377  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0626  RNA modification enzyme, MiaB family  35.44 
 
 		 439 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.196268  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1749  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.34 
 
 		 451 aa  262  8e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000349639  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2810  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.55 
 
 		 421 aa  262  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1349  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.56 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1156  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.56 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.516492  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3229  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.31 
 
 		 416 aa  260  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0152656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0853  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.19 
 
 		 416 aa  259  8e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2738  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.26 
 
 		 447 aa  259  9e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000461297  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  31.69 
 
 		 480 aa  258  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0976  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.96 
 
 		 467 aa  257  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.0700259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>