More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0766 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  98.99 
 
 
397 aa  806    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
397 aa  814    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  65.27 
 
 
393 aa  519  1e-146  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  63.24 
 
 
398 aa  519  1e-146  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  42.14 
 
 
405 aa  278  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  42.14 
 
 
377 aa  264  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  41.58 
 
 
369 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  41.05 
 
 
369 aa  259  7e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  41.05 
 
 
369 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  39.53 
 
 
371 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  38.53 
 
 
495 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  38.16 
 
 
372 aa  242  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  37.41 
 
 
451 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  38.74 
 
 
369 aa  241  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  40.87 
 
 
368 aa  241  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  37.99 
 
 
366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  39.39 
 
 
369 aa  231  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  39.05 
 
 
378 aa  220  3e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  38.5 
 
 
410 aa  219  6e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  38.59 
 
 
412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  38.96 
 
 
398 aa  209  5e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  34.72 
 
 
360 aa  208  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  38.31 
 
 
393 aa  206  7e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  36.52 
 
 
372 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  29.66 
 
 
435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 
529 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  30.85 
 
 
444 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  26.33 
 
 
459 aa  94.7  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1852  RNA modification enzyme, MiaB family  28.27 
 
 
440 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.417031  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 
497 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1724  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.57 
 
 
440 aa  86.7  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  27.63 
 
 
430 aa  86.3  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3373  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.78 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2115  RNA modification enzyme, MiaB family  27.92 
 
 
440 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.732779  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00700  putative SAM/TRAM family methylase protein  29.07 
 
 
482 aa  84.3  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2296  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.22 
 
 
441 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00249706  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  29.59 
 
 
562 aa  83.6  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2129  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.24 
 
 
438 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0560251  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  24.75 
 
 
459 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  26.3 
 
 
488 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  27.91 
 
 
475 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  24.8 
 
 
449 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  27.46 
 
 
501 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 
476 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 
487 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0278  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30 
 
 
443 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30 
 
 
443 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0476614  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1120  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.88 
 
 
447 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  27.56 
 
 
441 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2198  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.93 
 
 
446 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.972973  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  25.25 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  27.61 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07430  tRNA-N(6)-(isopentenyl)adenosine-37 thiotransferase enzyme MiaB  30.85 
 
 
448 aa  80.9  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000348325  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  23.82 
 
 
528 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10770  tRNA-N(6)-(isopentenyl)adenosine-37 thiotransferase enzyme MiaB  32.66 
 
 
451 aa  80.9  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.46991  unclonable  0.00000000221813 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 
533 aa  80.5  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3365  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.21 
 
 
452 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  23.34 
 
 
450 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0963  RNA modification enzyme, MiaB family  29.13 
 
 
432 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5916  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.03 
 
 
473 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00612207  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2979  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.77 
 
 
459 aa  80.1  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0122351  hitchhiker  0.00203806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1515  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.74 
 
 
442 aa  79.7  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.561512  normal  0.183018 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 
476 aa  79.7  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3625  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.48 
 
 
448 aa  79.7  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0208192  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.23 
 
 
476 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 
437 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1115  RNA modification protein  26.33 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  26.75 
 
 
441 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1721  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.82 
 
 
450 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.081167  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0774  RNA modification enzyme, MiaB family  30 
 
 
455 aa  78.6  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0255462  normal  0.23064 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0512  Radical SAM domain protein  24.45 
 
 
486 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2123  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  28.32 
 
 
451 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000417118  normal  0.0490217 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0983  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  31.48 
 
 
440 aa  79  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000730864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2935  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.16 
 
 
448 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.448542  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.17 
 
 
437 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0531  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.9 
 
 
457 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.280918  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  31.07 
 
 
448 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12746  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.73 
 
 
512 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000618798  normal  0.207012 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  31.07 
 
 
448 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0875  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.1 
 
 
449 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633872  normal  0.103821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1821  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.64 
 
 
481 aa  77.4  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0513029 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  25.43 
 
 
1288 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0968  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.61 
 
 
454 aa  77  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0408  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.8 
 
 
456 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0673  RNA modification enzyme, MiaB family  29.56 
 
 
496 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.323598 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2472  radical SAM domain-containing protein  25.35 
 
 
507 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 
600 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0065  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  30.77 
 
 
451 aa  76.3  0.0000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0423  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.8 
 
 
456 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.502734  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  22.85 
 
 
441 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  30.61 
 
 
444 aa  76.3  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000242644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2429  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.69 
 
 
510 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 
438 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1849  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.77 
 
 
439 aa  75.5  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218308  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3236  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.7 
 
 
480 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.703732 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 
461 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  25.83 
 
 
518 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1123  RNA modification enzyme, MiaB family  28.94 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58425  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0185  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.1 
 
 
440 aa  75.1  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3779  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.58 
 
 
459 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>