More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0986 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 600 aa  1258    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  48.89 
 
 		 498 aa  487  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  47.28 
 
 		 502 aa  473  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  47.28 
 
 		 509 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  46.56 
 
 		 520 aa  472  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  47.27 
 
 		 504 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  47.71 
 
 		 500 aa  468  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  47.67 
 
 		 502 aa  464  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  45.88 
 
 		 501 aa  463  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  46.15 
 
 		 493 aa  464  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  46.76 
 
 		 503 aa  456  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  46.59 
 
 		 504 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  46.76 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  46.96 
 
 		 498 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  46.64 
 
 		 504 aa  458  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  46.59 
 
 		 512 aa  455  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  47.17 
 
 		 503 aa  452  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  46.65 
 
 		 490 aa  442  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2895  cobalamin vitamin B12-binding / radical SAM protein  41.02 
 
 		 546 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2939  radical SAM domain-containing protein  43.88 
 
 		 521 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.379543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  40.12 
 
 		 529 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  41.46 
 
 		 527 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  41.44 
 
 		 529 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  40.93 
 
 		 529 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  47.8 
 
 		 533 aa  382  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  46.88 
 
 		 529 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  47.68 
 
 		 522 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  41.8 
 
 		 524 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  40.75 
 
 		 522 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  49.06 
 
 		 524 aa  362  1e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3826  radical SAM domain-containing protein  45.24 
 
 		 561 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  39.8 
 
 		 525 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  45.93 
 
 		 523 aa  347  4e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  40.16 
 
 		 533 aa  347  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3182  radical SAM domain-containing protein  41.73 
 
 		 534 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0165397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1896  Radical SAM domain protein  33.9 
 
 		 554 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  35.8 
 
 		 547 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1718  radical SAM family protein  35.2 
 
 		 527 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545031  normal  0.172284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 		 542 aa  273  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  37.23 
 
 		 527 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1895  Radical SAM domain protein  37.89 
 
 		 546 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  32.23 
 
 		 547 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  32.23 
 
 		 547 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3160  Radical SAM domain protein  36.45 
 
 		 539 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 		 531 aa  267  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  35.66 
 
 		 547 aa  266  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3580  radical SAM family protein  34.51 
 
 		 527 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161582  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  34.17 
 
 		 528 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  37.93 
 
 		 543 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  37.23 
 
 		 523 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2276  Fe-S oxidoreductase  36.6 
 
 		 553 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0810466  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  38.19 
 
 		 532 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1712  radical SAM family protein  35.64 
 
 		 528 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5358  normal  0.03933 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2689  radical SAM family protein  36.07 
 
 		 527 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  36.12 
 
 		 527 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  33.08 
 
 		 444 aa  206  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  31.95 
 
 		 433 aa  182  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  32.27 
 
 		 429 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  31.65 
 
 		 446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  28.34 
 
 		 439 aa  172  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  33.43 
 
 		 459 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  30.32 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  31.69 
 
 		 430 aa  164  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  28.43 
 
 		 428 aa  163  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  28.93 
 
 		 448 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 		 444 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  29.7 
 
 		 462 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  30.86 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  28.2 
 
 		 441 aa  152  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 		 449 aa  151  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  27.38 
 
 		 490 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 		 480 aa  147  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  26.99 
 
 		 477 aa  144  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  28.23 
 
 		 428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  29.08 
 
 		 471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  27.43 
 
 		 483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  29.08 
 
 		 471 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  29.73 
 
 		 426 aa  141  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  29.37 
 
 		 486 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  28.98 
 
 		 471 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.06 
 
 		 472 aa  136  9e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.82 
 
 		 478 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  30.04 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 		 445 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 		 471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  28.13 
 
 		 477 aa  131  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  29.09 
 
 		 441 aa  132  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.09 
 
 		 441 aa  130  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  27.43 
 
 		 474 aa  130  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1089  radical SAM family Fe-S protein  27.55 
 
 		 591 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.977516  normal  0.0200721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 		 451 aa  128  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  27.9 
 
 		 477 aa  128  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 		 473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  28.41 
 
 		 472 aa  127  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.05 
 
 		 471 aa  126  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  26.1 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 476 aa  123  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.25 
 
 		 479 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 		 470 aa  122  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>