More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1469 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  100 
 
 		 368 aa  763    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  62.7 
 
 		 377 aa  484  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  53.01 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  46.3 
 
 		 369 aa  323  2e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  46.03 
 
 		 369 aa  322  5e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  46.56 
 
 		 369 aa  322  7e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  44.41 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  47.12 
 
 		 369 aa  285  7e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  41.44 
 
 		 369 aa  285  7e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  40.53 
 
 		 366 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  41.15 
 
 		 378 aa  271  9e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  42.05 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  39.78 
 
 		 372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  38.79 
 
 		 495 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  37.79 
 
 		 393 aa  236  6e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  37.63 
 
 		 398 aa  235  9e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  40.87 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  40.56 
 
 		 397 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  39.19 
 
 		 405 aa  224  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  33.98 
 
 		 451 aa  199  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  33.63 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  32.53 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  30.9 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  30.46 
 
 		 444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  29.8 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 		 529 aa  100  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2473  radical SAM domain-containing protein  25.45 
 
 		 468 aa  89.7  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0785227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  28.62 
 
 		 518 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  27.44 
 
 		 554 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 562 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3553  Radical SAM domain protein  27.4 
 
 		 474 aa  86.3  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 		 533 aa  84  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1537  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.44 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.537529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  27.48 
 
 		 461 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  28.83 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3552  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 488 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  33.13 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 		 524 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0516  radical SAM domain-containing protein  25.25 
 
 		 501 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0873  radical SAM family Fe-S protein  25.33 
 
 		 501 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  25.55 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.17 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.22 
 
 		 441 aa  79.7  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 441 aa  79.3  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0597  radical SAM family protein  24.76 
 
 		 501 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.678652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 		 528 aa  79  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0876  radical SAM family Fe-S protein  25 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 		 520 aa  77  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 		 488 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0940  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.92 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.481544 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 467 aa  76.3  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 470 aa  76.3  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  23.86 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0242  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.68 
 
 		 473 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 556 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2888  B12 binding /radical SAM domain-containing protein  23.2 
 
 		 503 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2472  radical SAM domain-containing protein  22.88 
 
 		 507 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  26.33 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  27.53 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1724  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.5 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  25.5 
 
 		 459 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 564 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 520 aa  73.6  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1115  RNA modification protein  29.56 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1318  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.87 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1644  radical SAM domain-containing protein  24.91 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1544  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  26.94 
 
 		 563 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2296  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.69 
 
 		 441 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00249706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0590  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.23 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.632056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0316  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.99 
 
 		 567 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 502 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  25.69 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1165  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 528 aa  70.9  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.01 
 
 		 524 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2592  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.89 
 
 		 608 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000154642  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  23.43 
 
 		 529 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0114  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.11 
 
 		 609 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1897  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 559 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.1 
 
 		 484 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 		 597 aa  70.5  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.55 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0879  radical SAM family Fe-S protein  24.33 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3467  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 		 506 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0931  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.51 
 
 		 465 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.988397  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2628  radical SAM domain-containing protein  25.59 
 
 		 537 aa  70.1  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>