More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1466 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0940  Elongator protein 3/MiaB/NifB  73.48 
 
 
461 aa  739    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.481544 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1318  Elongator protein 3/MiaB/NifB  79.83 
 
 
471 aa  803    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1617  Radical SAM domain protein  79.91 
 
 
469 aa  782    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0931  Elongator protein 3/MiaB/NifB  83.18 
 
 
465 aa  815    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.988397  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1537  Elongator protein 3/MiaB/NifB  72.77 
 
 
462 aa  723    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.537529  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  100 
 
 
467 aa  981    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1023  Radical SAM domain protein  81.37 
 
 
467 aa  827    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1516  Radical SAM domain protein  83.33 
 
 
469 aa  840    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0112694  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1644  radical SAM domain-containing protein  82.87 
 
 
468 aa  826    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  37.06 
 
 
444 aa  259  9e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  33.92 
 
 
433 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  34.05 
 
 
439 aa  233  6e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  33.25 
 
 
434 aa  229  8e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  31.19 
 
 
428 aa  227  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  32.11 
 
 
426 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  31.88 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1975  Radical SAM domain protein  29.06 
 
 
468 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00675749  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1806  Radical SAM domain protein  31.08 
 
 
468 aa  209  7e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2731  Radical SAM domain protein  30.37 
 
 
465 aa  207  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0267  Radical SAM domain protein  28.51 
 
 
469 aa  206  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626864  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  29.4 
 
 
448 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  33.33 
 
 
430 aa  206  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  33.16 
 
 
429 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0407  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.6 
 
 
466 aa  204  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201202  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  32.65 
 
 
428 aa  204  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0200  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 
468 aa  204  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0997671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  30.26 
 
 
444 aa  204  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2757  Radical SAM domain protein  28.86 
 
 
462 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  30.95 
 
 
434 aa  200  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0116  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.49 
 
 
461 aa  199  6e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  30.48 
 
 
441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.86 
 
 
479 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 
462 aa  190  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 
459 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  32.13 
 
 
433 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  29.71 
 
 
449 aa  189  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.82 
 
 
471 aa  187  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 
470 aa  187  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  30.38 
 
 
486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 
480 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 
446 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 
475 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  30.49 
 
 
445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 
483 aa  178  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  29.11 
 
 
477 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  28.9 
 
 
471 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  28.9 
 
 
471 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  27.09 
 
 
471 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 
477 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 
474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 
477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 
476 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 
473 aa  161  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  28.61 
 
 
490 aa  161  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.51 
 
 
478 aa  158  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  23.8 
 
 
472 aa  157  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.17 
 
 
472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3556  Radical SAM domain protein  29.2 
 
 
450 aa  148  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.58 
 
 
441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  27.58 
 
 
441 aa  147  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 
468 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 
471 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1164  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 
481 aa  143  8e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  25.06 
 
 
451 aa  142  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3555  Radical SAM domain protein  27.39 
 
 
448 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1163  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 
444 aa  126  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0919  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 
422 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0513  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 
445 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000241934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3535  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 
444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  25.88 
 
 
532 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  22.89 
 
 
527 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0820  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 
583 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 
459 aa  113  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  25.06 
 
 
484 aa  113  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0515  Radical SAM domain protein  26.72 
 
 
603 aa  113  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1089  radical SAM family Fe-S protein  27.51 
 
 
591 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.977516  normal  0.0200721 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05330  Fe-S oxidoreductase  22.99 
 
 
495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0114  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.09 
 
 
609 aa  111  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0513  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 
609 aa  111  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2592  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.2 
 
 
608 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000154642  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 
490 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  25.72 
 
 
547 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  24.87 
 
 
503 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 
470 aa  109  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 
531 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3548  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.22 
 
 
535 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  24.52 
 
 
542 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 
576 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 
576 aa  106  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  23.41 
 
 
503 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0138  Radical SAM domain protein  26.15 
 
 
608 aa  106  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000809293  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  23.74 
 
 
493 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1895  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 
546 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556208 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1668  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.29 
 
 
612 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0607785  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  31.98 
 
 
424 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 
520 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3580  radical SAM family protein  25.31 
 
 
527 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161582  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 
502 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3812  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.76 
 
 
569 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 
512 aa  103  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>