More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2628 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2628  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 537 aa  1110    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  26.87 
 
 		 518 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1633  radical SAM domain-containing protein  27.93 
 
 		 490 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  25.78 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 502 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 		 469 aa  108  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 470 aa  107  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 		 489 aa  107  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 521 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 		 556 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  28.21 
 
 		 563 aa  104  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 		 1288 aa  103  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.79 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  26.27 
 
 		 520 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  25.64 
 
 		 472 aa  98.6  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 529 aa  98.2  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 533 aa  98.6  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0114  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.55 
 
 		 609 aa  97.8  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.87 
 
 		 485 aa  97.8  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 524 aa  96.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0138  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 608 aa  95.5  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000809293  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 476 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4090  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 462 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 564 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  28.79 
 
 		 377 aa  94.7  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 459 aa  92.8  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.25 
 
 		 674 aa  93.2  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  25.74 
 
 		 475 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  24.8 
 
 		 501 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.44 
 
 		 473 aa  92.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.44 
 
 		 473 aa  91.3  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  24.81 
 
 		 475 aa  90.9  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0874  radical SAM family Fe-S protein  25.86 
 
 		 501 aa  90.9  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 494 aa  91.3  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 461 aa  90.1  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.3 
 
 		 476 aa  90.1  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.3 
 
 		 554 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3401  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 		 484 aa  89  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.92 
 
 		 484 aa  89  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 494 aa  88.2  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  24.38 
 
 		 548 aa  87.4  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1435  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 631 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0826343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3359  Radical SAM domain protein  22.08 
 
 		 539 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0873  radical SAM family Fe-S protein  24.65 
 
 		 501 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  24.93 
 
 		 864 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3991  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 		 572 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  24.51 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1165  Radical SAM domain protein  23.48 
 
 		 506 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3533  Radical SAM domain protein  23.77 
 
 		 506 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  23.8 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  26.87 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  24.02 
 
 		 476 aa  83.6  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3467  Radical SAM domain protein  23.48 
 
 		 506 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1535  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.7 
 
 		 651 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 562 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  22.61 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0027  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.7 
 
 		 651 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  24.94 
 
 		 494 aa  81.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1460  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.7 
 
 		 651 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0033  B12-binding/radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 647 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10215  methyltransferase  26.07 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.14 
 
 		 681 aa  82  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0515  Radical SAM domain protein  26.12 
 
 		 603 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  24.42 
 
 		 494 aa  81.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0033  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.7 
 
 		 647 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1180  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.7 
 
 		 647 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3408  radical SAM family protein  25.14 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0047  Fe-S oxidoreductase  26.7 
 
 		 647 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  25.8 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  24.62 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2592  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.92 
 
 		 608 aa  80.5  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000154642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 472 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6404  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase 66kD subunit  24.55 
 
 		 534 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.38 
 
 		 512 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0820  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 583 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 		 564 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3863  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.46 
 
 		 580 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582854  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 487 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  27.92 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.27 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 576 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3504  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  25.9 
 
 		 677 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1625  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  26.81 
 
 		 558 aa  78.6  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0030  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  25.61 
 
 		 647 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1668  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.46 
 
 		 612 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0607785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  23.83 
 
 		 552 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0942  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.93 
 
 		 528 aa  77.4  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0879  radical SAM family Fe-S protein  23.75 
 
 		 488 aa  77.4  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 1250 aa  77.4  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0513  Radical SAM domain protein  26.08 
 
 		 609 aa  77  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0316  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  26.13 
 
 		 567 aa  77  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2074  radical SAM binding protein  27.13 
 
 		 598 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4778  response regulator receiver protein  25 
 
 		 675 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0104454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>