More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0750 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 405 aa  818    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  40.15 
 
 		 495 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  41.03 
 
 		 451 aa  296  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  44.22 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  40.49 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  41.65 
 
 		 369 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  42.14 
 
 		 397 aa  266  5e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  42.14 
 
 		 397 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  41.65 
 
 		 369 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  41.39 
 
 		 369 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  42.77 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  44.84 
 
 		 378 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  44.73 
 
 		 369 aa  239  8e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  40.39 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  44.3 
 
 		 371 aa  229  5e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  39.19 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  40.45 
 
 		 366 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  36.72 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  36.9 
 
 		 360 aa  208  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  38.2 
 
 		 369 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  36.39 
 
 		 410 aa  206  7e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  37.99 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  36.47 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  34.72 
 
 		 412 aa  197  3e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  31.55 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  29.74 
 
 		 444 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  29.18 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 		 461 aa  97.1  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 		 1250 aa  93.6  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 		 470 aa  92.8  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.5 
 
 		 441 aa  92.8  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0710  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 		 516 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  29.45 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  25.66 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 441 aa  90.1  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 		 502 aa  89  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 		 520 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 		 459 aa  89.4  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 441 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 533 aa  88.6  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 524 aa  87.8  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0893  Radical SAM domain protein  24.27 
 
 		 681 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.878222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 		 520 aa  87.4  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  31.02 
 
 		 437 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  25.32 
 
 		 472 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 562 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  30.66 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 502 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  26.01 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 487 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  26.75 
 
 		 528 aa  83.6  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 529 aa  84  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0180  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.84 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  27.19 
 
 		 554 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1897  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.487619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0114  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.98 
 
 		 609 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  28.26 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  25.96 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2352  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.94 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.33 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2881  coproporphyrinogen III oxidase  31.28 
 
 		 494 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969668  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0513  Radical SAM domain protein  27.07 
 
 		 609 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0046  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.08 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.954512 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 		 488 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.23 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0815  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.14 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.518206  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0876  radical SAM family Fe-S protein  25.48 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3261  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.43 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.803494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  27.05 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.27 
 
 		 476 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  22.62 
 
 		 518 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 521 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 		 497 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  26.09 
 
 		 864 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1181  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.16 
 
 		 474 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1829  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.92 
 
 		 482 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1163  Radical SAM domain protein  24.5 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3439  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.14 
 
 		 474 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1106  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.14 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000160035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0713  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.38 
 
 		 474 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0124358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3303  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.14 
 
 		 474 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668925  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0837  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.07 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.994025  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  26.37 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  24.57 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0920  radical SAM domain-containing protein  23.8 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  26.37 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2915  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.92 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000321738  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 576 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0832  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  25.91 
 
 		 471 aa  76.3  0.0000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0513  radical SAM domain-containing protein  25.78 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000241934  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0940  Elongator protein 3/MiaB/NifB  21.96 
 
 		 461 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.481544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 576 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3696  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.84 
 
 		 474 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00523975  hitchhiker  0.00388366 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.76 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0873  radical SAM family Fe-S protein  23.41 
 
 		 501 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1195  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0161  radical SAM domain-containing protein  27.48 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>