More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1202 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 412 aa  826    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  85.18 
 
 		 398 aa  713    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  73.54 
 
 		 410 aa  619  1e-176  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  73.12 
 
 		 393 aa  605  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  34.16 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  38.87 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  36.23 
 
 		 393 aa  203  6e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  38.59 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  34.72 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  36 
 
 		 495 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  34.12 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  30.5 
 
 		 369 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  34.5 
 
 		 451 aa  172  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  31.09 
 
 		 369 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  32.92 
 
 		 369 aa  169  9e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  33.43 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  33.42 
 
 		 377 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  32.79 
 
 		 372 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  32.74 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  34.47 
 
 		 378 aa  160  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  32.2 
 
 		 366 aa  153  7e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  33.92 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  33.65 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  32.46 
 
 		 369 aa  144  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  30.72 
 
 		 444 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  29.35 
 
 		 435 aa  94  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 		 497 aa  82  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  24.61 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  23.85 
 
 		 551 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 		 562 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1701  radical SAM family protein  27.93 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00126936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  24.91 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 		 529 aa  73.2  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 		 551 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  22.36 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.85 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2472  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 		 1250 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  26.64 
 
 		 567 aa  67.4  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  31.79 
 
 		 306 aa  67  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0849  RNA modification enzyme, MiaB family  27.8 
 
 		 458 aa  67  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2352  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.37 
 
 		 443 aa  67  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25 
 
 		 443 aa  66.2  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0476614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0278  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25 
 
 		 443 aa  66.2  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  28.23 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1341  coproporphyrinogen III oxidase  28.72 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.996503  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.57 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1757  Radical SAM domain protein  23.41 
 
 		 535 aa  64.3  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0257963  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  26.63 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0394  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  25.29 
 
 		 508 aa  63.2  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73924 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.52 
 
 		 512 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0247  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 		 487 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0512  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  29.91 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3411  coproporphyrinogen III oxidase  30 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.06 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0550  coproporphyrinogen III oxidase  27.27 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.790548  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  28.27 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 515 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0964  putative radical SAM protein  28.5 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0893  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  27.45 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188426  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4804  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  24.62 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.557764  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  27.8 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  30.39 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0689  RNA modification enzyme, MiaB family  26.32 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0454  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.91 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000369122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3377  coproporphyrinogen III oxidase  29.61 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 		 595 aa  60.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4345  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.66 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0963  RNA modification enzyme, MiaB family  26.64 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  34.55 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1349  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.84 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  27.23 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0531  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.45 
 
 		 457 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.280918  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1156  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.84 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.516492  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0055  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.37 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  30.35 
 
 		 575 aa  59.7  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  27.8 
 
 		 314 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0208  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.71 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0874  radical SAM family Fe-S protein  25.94 
 
 		 501 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.06 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0971  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.32 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0545  Coproporphyrinogen dehydrogenase  27.43 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.693751  normal  0.412237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0367  radical SAM family protein  27.08 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0395363  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.69 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.34 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  26.04 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1120  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.06 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2313  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 532 aa  58.9  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.356702  hitchhiker  0.00154549 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  27.62 
 
 		 613 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2215  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.892548  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0697  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.79 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.504316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>