104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1297 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  89.88 
 
 		 595 aa  1052    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  75.83 
 
 		 625 aa  888    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  74.23 
 
 		 590 aa  889    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  78.71 
 
 		 572 aa  932    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 575 aa  1171    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  44.94 
 
 		 575 aa  483  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  43.73 
 
 		 566 aa  473  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  45.14 
 
 		 551 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  44.6 
 
 		 551 aa  434  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  43.35 
 
 		 553 aa  420  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  40.35 
 
 		 556 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  42.03 
 
 		 542 aa  413  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  42.06 
 
 		 551 aa  409  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  44.22 
 
 		 547 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  42.27 
 
 		 565 aa  404  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  39.33 
 
 		 565 aa  397  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  41.09 
 
 		 565 aa  397  1e-109  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  39.02 
 
 		 532 aa  399  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  41.61 
 
 		 557 aa  394  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  40.77 
 
 		 550 aa  393  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  40.94 
 
 		 565 aa  394  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  42.03 
 
 		 556 aa  391  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  41.14 
 
 		 510 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  41.56 
 
 		 509 aa  379  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  41.63 
 
 		 510 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  41.25 
 
 		 510 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  38.65 
 
 		 517 aa  367  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  40.7 
 
 		 535 aa  360  3e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  39.93 
 
 		 567 aa  359  9e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  39.3 
 
 		 515 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  30.35 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  30.72 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 393 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.55 
 
 		 420 aa  54.7  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  22.09 
 
 		 398 aa  50.8  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0018  MiaB family tRNA modification protein  31.36 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 494 aa  50.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1414  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.23 
 
 		 420 aa  50.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0797  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.61 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2807  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  26.83 
 
 		 485 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125377  hitchhiker  0.0000111604 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  20.67 
 
 		 368 aa  48.9  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0618  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.79 
 
 		 448 aa  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000754849  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1314  hypothetical protein  43.28 
 
 		 453 aa  48.1  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395672  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1444  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  23.71 
 
 		 443 aa  47.8  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1803  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  44.78 
 
 		 524 aa  48.1  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.6995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3120  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  44.78 
 
 		 443 aa  47.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  23.12 
 
 		 528 aa  47.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2751  hypothetical protein  24.01 
 
 		 440 aa  47.4  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.639812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0252  MiaB-like tRNA modifying enzyme  23.67 
 
 		 423 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1354  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  27.72 
 
 		 507 aa  47  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1787  putative tRNA modifying protein  43.28 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.738768  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1536  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  44.78 
 
 		 525 aa  46.6  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262193 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1715  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  44.78 
 
 		 531 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 497 aa  46.6  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2197  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40.3 
 
 		 470 aa  47  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3089  hypothetical protein  65.62 
 
 		 138 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000479823  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1849  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.922054 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0353  hypothetical protein  29.89 
 
 		 466 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  28.43 
 
 		 494 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1639  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  44.78 
 
 		 448 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.981602 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0632  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.3 
 
 		 448 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.3058599999999997e-35 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2382  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  24.5 
 
 		 453 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00199073  normal  0.128025 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2497  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.67 
 
 		 411 aa  45.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0715823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0412  MiaB-like tRNA modifying enzyme  23.33 
 
 		 437 aa  45.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.908018  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3747  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.48 
 
 		 424 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26780  predicted protein  44.23 
 
 		 516 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4276  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.66 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0184  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.81 
 
 		 412 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2590  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  43.28 
 
 		 468 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.58458  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4336  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.66 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1944  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  41.94 
 
 		 437 aa  45.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1074  hypothetical protein  39.47 
 
 		 432 aa  44.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 515 aa  44.7  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1614  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40.26 
 
 		 471 aa  45.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0719193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3627  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  43.28 
 
 		 437 aa  44.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.109581  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1853  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 548 aa  44.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4866  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.03 
 
 		 449 aa  45.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1673  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  41.94 
 
 		 442 aa  45.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  29.32 
 
 		 564 aa  45.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1913  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  34.19 
 
 		 454 aa  45.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.823404  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2337  hypothetical protein  21.94 
 
 		 458 aa  44.7  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.587976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02161  Fe-S oxidoreductase  36.84 
 
 		 472 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2303  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  41.94 
 
 		 467 aa  44.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.941264  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2402  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40.32 
 
 		 467 aa  44.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  20.77 
 
 		 377 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3094  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.94 
 
 		 450 aa  44.3  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000316014  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2787  radical SAM domain-containing protein  36.67 
 
 		 543 aa  44.3  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  26.62 
 
 		 542 aa  44.3  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1758  DNA uptake protein and related DNA-binding proteins  52.78 
 
 		 110 aa  43.9  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  43.18 
 
 		 523 aa  43.9  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6297  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.15 
 
 		 453 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1782  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.15 
 
 		 453 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339702  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  19.17 
 
 		 371 aa  43.9  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3231  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  24.17 
 
 		 440 aa  44.3  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.12995  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  36 
 
 		 527 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2745  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.86 
 
 		 200 aa  43.9  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000236948  normal  0.898271 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0926  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  25.54 
 
 		 452 aa  43.9  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 		 451 aa  43.9  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>