56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1438 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  67.5 
 
 
510 aa  716    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  67.77 
 
 
510 aa  711    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
517 aa  1041    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  67.5 
 
 
509 aa  714    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  67.31 
 
 
510 aa  714    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  45.7 
 
 
575 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  44.12 
 
 
566 aa  413  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  41.44 
 
 
553 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  40.46 
 
 
565 aa  372  1e-102  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  40.66 
 
 
532 aa  374  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  40.27 
 
 
565 aa  370  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  41.54 
 
 
565 aa  371  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  39.25 
 
 
595 aa  371  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  39.58 
 
 
551 aa  367  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  37.69 
 
 
572 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  38.65 
 
 
575 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  40.46 
 
 
565 aa  365  1e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  37.82 
 
 
625 aa  363  4e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  38.88 
 
 
547 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  36.94 
 
 
590 aa  353  4e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  38.92 
 
 
551 aa  350  5e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  38.92 
 
 
551 aa  350  5e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  40.39 
 
 
557 aa  343  4e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  39.96 
 
 
556 aa  343  5.999999999999999e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  38.76 
 
 
550 aa  343  5.999999999999999e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  39 
 
 
567 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  39.46 
 
 
535 aa  330  4e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  39.04 
 
 
542 aa  330  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  39.11 
 
 
515 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  36.06 
 
 
556 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  24.61 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 
435 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1630  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  23.95 
 
 
436 aa  53.9  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0566409  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 
369 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 
405 aa  50.8  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0078  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  25.38 
 
 
435 aa  50.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 
430 aa  49.7  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  26.89 
 
 
444 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
369 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 
369 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0071  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.96 
 
 
430 aa  47.4  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0865  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  23.01 
 
 
440 aa  46.2  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0318613  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2599  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  29.44 
 
 
487 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000474817  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0256  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  23.37 
 
 
430 aa  45.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0957  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  26.94 
 
 
430 aa  45.4  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00162656  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0935  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  26.94 
 
 
430 aa  45.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000136513  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  43.4 
 
 
455 aa  44.3  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3124  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  21.73 
 
 
442 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000009336  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  21.79 
 
 
366 aa  44.3  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  23.24 
 
 
435 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  20.67 
 
 
497 aa  43.9  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 
438 aa  43.9  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  23.15 
 
 
377 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  22.33 
 
 
447 aa  43.5  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00700  putative SAM/TRAM family methylase protein  21.84 
 
 
482 aa  43.5  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47281  predicted protein  25.6 
 
 
690 aa  43.5  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>