38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2247 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  100 
 
 		 566 aa  1152    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  61.26 
 
 		 575 aa  736    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  49.29 
 
 		 553 aa  499  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  44.98 
 
 		 590 aa  491  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  45.29 
 
 		 551 aa  484  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  44.78 
 
 		 572 aa  478  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  43.43 
 
 		 625 aa  475  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  43.73 
 
 		 575 aa  473  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  43.21 
 
 		 595 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  46.25 
 
 		 547 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  45.64 
 
 		 550 aa  451  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  44.8 
 
 		 557 aa  445  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  41.11 
 
 		 565 aa  441  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  42.09 
 
 		 565 aa  441  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  41.61 
 
 		 551 aa  437  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  41.84 
 
 		 551 aa  437  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  40.94 
 
 		 565 aa  433  1e-120  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  41.74 
 
 		 565 aa  431  1e-119  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  41.16 
 
 		 532 aa  429  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  41.38 
 
 		 556 aa  428  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  40.83 
 
 		 542 aa  428  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  44.05 
 
 		 510 aa  421  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  44.12 
 
 		 517 aa  413  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  41.47 
 
 		 556 aa  410  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  43.69 
 
 		 510 aa  412  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  43.39 
 
 		 510 aa  412  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  42.69 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  38.57 
 
 		 535 aa  375  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  39.11 
 
 		 567 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  37.48 
 
 		 515 aa  332  1e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0797  Radical SAM domain protein  32.65 
 
 		 489 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1055  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.77 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1849  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.22 
 
 		 439 aa  45.4  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2745  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 200 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000236948  normal  0.898271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3089  hypothetical protein  40 
 
 		 138 aa  44.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000479823  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0124  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 625 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0216543  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 515 aa  44.7  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2843  MiaB-like tRNA modifying enzyme  22.22 
 
 		 410 aa  44.3  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495489  normal  0.451673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>