41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3089 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3089  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  259  6.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000479823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2824  hypothetical protein  59.32 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000715394  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0210  hypothetical protein  48.75 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0267278 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0405  hypothetical protein  40.52 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0364  hypothetical protein  53.85 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0519  hypothetical protein  49.38 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2811  helix-hairpin-helix motif protein  55.93 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2424  hypothetical protein  50.6 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4078  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00569663  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0205  hypothetical protein  50.7 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288848  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2496  hypothetical protein  56.25 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.942964  normal  0.277231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2719  hypothetical protein  56.25 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.0856315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5921  helix-hairpin-helix motif protein  52.54 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.946109  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5276  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  49.15 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1758  DNA uptake protein and related DNA-binding proteins  44.59 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5114  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  53.85 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.668052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2548  hypothetical protein  41.82 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2514  helix-hairpin-helix protein  43.08 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.355933  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4421  hypothetical protein  41.89 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.046952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4885  hypothetical protein  40.54 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1869  hypothetical protein  46.55 
 
 		 207 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00710485  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2839  hypothetical protein  40.79 
 
 		 184 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2745  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  44.23 
 
 		 200 aa  50.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000236948  normal  0.898271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4931  hypothetical protein  41.38 
 
 		 188 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5924  hypothetical protein  39.58 
 
 		 202 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.11783  normal  0.310125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4496  hypothetical protein  38.98 
 
 		 199 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0369659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4563  hypothetical protein  39.29 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00101881 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3498  hypothetical protein  35.44 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  65.62 
 
 		 575 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3472  hypothetical protein  26.19 
 
 		 332 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.33558 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  40 
 
 		 566 aa  43.9  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2038  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  32.11 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  58.33 
 
 		 595 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1025  helix-hairpin-helix motif protein  38.1 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0837725  normal  0.434373 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3191  helix-hairpin-helix motif protein  31.18 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.732277 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3010  competence protein ComEA  42.86 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  34.55 
 
 		 532 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 551 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0496  DNA uptake-like protein  30.19 
 
 		 220 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0194671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  48.89 
 
 		 551 aa  40  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3047  helix-hairpin-helix motif protein  26.79 
 
 		 116 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>