21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4563 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4563  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  381  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00101881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4496  hypothetical protein  48.89 
 
 		 199 aa  131  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0369659  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4421  hypothetical protein  59.26 
 
 		 182 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.046952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2839  hypothetical protein  59.26 
 
 		 184 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4885  hypothetical protein  58.02 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1869  hypothetical protein  40.45 
 
 		 207 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00710485  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4931  hypothetical protein  66.67 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5924  hypothetical protein  39.07 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.11783  normal  0.310125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3472  hypothetical protein  41.46 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.33558 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1787  hypothetical protein  42.19 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0364  hypothetical protein  39.33 
 
 		 121 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1761  hypothetical protein  30.68 
 
 		 345 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0405  hypothetical protein  36.59 
 
 		 120 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0519  hypothetical protein  39.47 
 
 		 130 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2038  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  39.39 
 
 		 130 aa  48.5  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1758  DNA uptake protein and related DNA-binding proteins  39.39 
 
 		 110 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0205  hypothetical protein  38.18 
 
 		 127 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5921  helix-hairpin-helix motif protein  44.83 
 
 		 129 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.946109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3089  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000479823  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3191  helix-hairpin-helix motif protein  44.23 
 
 		 111 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.732277 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2424  hypothetical protein  41.38 
 
 		 133 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>