23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4496 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4496  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0369659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4563  hypothetical protein  82.76 
 
 		 212 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00101881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2839  hypothetical protein  73.02 
 
 		 184 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4421  hypothetical protein  58.44 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.046952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1869  hypothetical protein  39.81 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00710485  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4931  hypothetical protein  68.42 
 
 		 188 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4885  hypothetical protein  61.64 
 
 		 183 aa  89  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5924  hypothetical protein  35.55 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.11783  normal  0.310125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3472  hypothetical protein  51.67 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.33558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1761  hypothetical protein  32.97 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1787  hypothetical protein  41.67 
 
 		 342 aa  52.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0205  hypothetical protein  38.46 
 
 		 127 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288848  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0210  hypothetical protein  34.78 
 
 		 123 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0267278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0364  hypothetical protein  41.38 
 
 		 121 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0405  hypothetical protein  41.38 
 
 		 120 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3089  hypothetical protein  37.29 
 
 		 138 aa  45.1  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000479823  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5921  helix-hairpin-helix motif protein  46.55 
 
 		 129 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.946109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2038  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  36.21 
 
 		 130 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2424  hypothetical protein  37.66 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0519  hypothetical protein  39.66 
 
 		 130 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1758  DNA uptake protein and related DNA-binding proteins  33.33 
 
 		 110 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5276  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  44.83 
 
 		 152 aa  41.6  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4078  hypothetical protein  39.06 
 
 		 137 aa  41.2  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00569663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>