28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4421 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4421  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  343  5e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.046952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4885  hypothetical protein  95.08 
 
 		 183 aa  225  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4931  hypothetical protein  61.17 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1869  hypothetical protein  43.14 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00710485  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2839  hypothetical protein  69.49 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4496  hypothetical protein  67.8 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0369659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4563  hypothetical protein  68.42 
 
 		 212 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00101881 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5924  hypothetical protein  56.14 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.11783  normal  0.310125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3472  hypothetical protein  45 
 
 		 332 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.33558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0205  hypothetical protein  36.46 
 
 		 127 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288848  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0364  hypothetical protein  37.66 
 
 		 121 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0519  hypothetical protein  37.66 
 
 		 130 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0405  hypothetical protein  37.08 
 
 		 120 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2496  hypothetical protein  46.67 
 
 		 121 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.942964  normal  0.277231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2719  hypothetical protein  46.67 
 
 		 121 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.0856315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0210  hypothetical protein  34.38 
 
 		 123 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0267278 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3191  helix-hairpin-helix motif protein  37.35 
 
 		 111 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.732277 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3089  hypothetical protein  45.45 
 
 		 138 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000479823  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0329  DNA uptake protein  36 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5921  helix-hairpin-helix motif protein  42.37 
 
 		 129 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.946109  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2424  hypothetical protein  44.64 
 
 		 133 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5276  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.37 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1758  DNA uptake protein and related DNA-binding proteins  38.1 
 
 		 110 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1813  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  36.19 
 
 		 112 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1761  hypothetical protein  30.43 
 
 		 345 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17420  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  42.62 
 
 		 279 aa  41.6  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.711078  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1787  hypothetical protein  36.67 
 
 		 342 aa  41.6  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4078  hypothetical protein  35.11 
 
 		 137 aa  41.2  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00569663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>