30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2839 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2839  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  347  8e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4421  hypothetical protein  62.82 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.046952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4885  hypothetical protein  67.8 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4496  hypothetical protein  74.58 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0369659  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4931  hypothetical protein  67.24 
 
 		 188 aa  89  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1869  hypothetical protein  49.04 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00710485  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4563  hypothetical protein  70.18 
 
 		 212 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00101881 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5924  hypothetical protein  37.23 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.11783  normal  0.310125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3472  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.33558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0364  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0210  hypothetical protein  32.26 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0267278 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0205  hypothetical protein  30.23 
 
 		 127 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288848  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0519  hypothetical protein  36.84 
 
 		 130 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2496  hypothetical protein  43.86 
 
 		 121 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.942964  normal  0.277231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2719  hypothetical protein  43.86 
 
 		 121 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.0856315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5921  helix-hairpin-helix motif protein  41.67 
 
 		 129 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.946109  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5276  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.86 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2424  hypothetical protein  43.64 
 
 		 133 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3089  hypothetical protein  45.45 
 
 		 138 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000479823  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1761  hypothetical protein  36.67 
 
 		 345 aa  48.5  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2038  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  31.37 
 
 		 130 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5114  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.27 
 
 		 119 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.668052 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1787  hypothetical protein  33.33 
 
 		 342 aa  45.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0405  hypothetical protein  36.36 
 
 		 120 aa  45.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4078  hypothetical protein  44.64 
 
 		 137 aa  45.1  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00569663  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2811  helix-hairpin-helix motif protein  36.84 
 
 		 119 aa  45.1  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3191  helix-hairpin-helix motif protein  43.64 
 
 		 111 aa  44.3  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.732277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1758  DNA uptake protein and related DNA-binding proteins  32.73 
 
 		 110 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1103  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  29.41 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000407291  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3047  helix-hairpin-helix motif protein  43.64 
 
 		 116 aa  42.4  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>