25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4885 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4885  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  344  5e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4421  hypothetical protein  95.08 
 
 		 182 aa  236  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.046952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4931  hypothetical protein  61.7 
 
 		 188 aa  174  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1869  hypothetical protein  43.14 
 
 		 207 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00710485  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2839  hypothetical protein  67.8 
 
 		 184 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4496  hypothetical protein  66.1 
 
 		 199 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0369659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4563  hypothetical protein  66.67 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00101881 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5924  hypothetical protein  56.14 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.11783  normal  0.310125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3472  hypothetical protein  45 
 
 		 332 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.33558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0205  hypothetical protein  36.46 
 
 		 127 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288848  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0405  hypothetical protein  35.58 
 
 		 120 aa  52  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0364  hypothetical protein  37.66 
 
 		 121 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2496  hypothetical protein  46.67 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.942964  normal  0.277231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2719  hypothetical protein  46.67 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.0856315 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3191  helix-hairpin-helix motif protein  39.8 
 
 		 111 aa  48.9  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.732277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0519  hypothetical protein  38.1 
 
 		 130 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3089  hypothetical protein  45.45 
 
 		 138 aa  47.8  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000479823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0210  hypothetical protein  34.38 
 
 		 123 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0267278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2424  hypothetical protein  44.64 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0329  DNA uptake protein  28.11 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5276  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.37 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1758  DNA uptake protein and related DNA-binding proteins  38.1 
 
 		 110 aa  45.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17420  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  42.62 
 
 		 279 aa  42.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.711078  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1761  hypothetical protein  32.88 
 
 		 345 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1787  hypothetical protein  36.67 
 
 		 342 aa  41.2  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>