21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4931 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4931  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  352  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4421  hypothetical protein  68.09 
 
 		 182 aa  176  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.046952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4885  hypothetical protein  67.02 
 
 		 183 aa  171  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1869  hypothetical protein  43.6 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00710485  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4496  hypothetical protein  41.75 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0369659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2839  hypothetical protein  65.08 
 
 		 184 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4563  hypothetical protein  66.67 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00101881 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5924  hypothetical protein  49.4 
 
 		 202 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.11783  normal  0.310125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0205  hypothetical protein  38 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288848  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3472  hypothetical protein  37.65 
 
 		 332 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.33558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0364  hypothetical protein  37.21 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0405  hypothetical protein  37.63 
 
 		 120 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0519  hypothetical protein  34.69 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0210  hypothetical protein  31.63 
 
 		 123 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0267278 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3191  helix-hairpin-helix motif protein  44.64 
 
 		 111 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.732277 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3089  hypothetical protein  41.38 
 
 		 138 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000479823  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2496  hypothetical protein  42.86 
 
 		 121 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.942964  normal  0.277231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2719  hypothetical protein  42.86 
 
 		 121 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.0856315 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10556  ubiquitin chain assembly factor (Eurofung)  30.61 
 
 		 1095 aa  45.1  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5921  helix-hairpin-helix motif protein  40.68 
 
 		 129 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.946109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2038  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  33 
 
 		 130 aa  42.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>