93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1758 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1758  DNA uptake protein and related DNA-binding proteins  100 
 
 		 110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5276  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  59.32 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0210  hypothetical protein  50.62 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0267278 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0205  hypothetical protein  43.43 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5921  helix-hairpin-helix motif protein  54.24 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.946109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2824  hypothetical protein  48.44 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000715394  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2424  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4078  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00569663  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0519  hypothetical protein  55.93 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2719  hypothetical protein  55.93 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.0856315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2496  hypothetical protein  55.93 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.942964  normal  0.277231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2811  helix-hairpin-helix motif protein  57.63 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0364  hypothetical protein  51.61 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3089  hypothetical protein  48.39 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000479823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2038  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  53.57 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0405  hypothetical protein  50.82 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2514  helix-hairpin-helix protein  45.76 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.355933  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3047  helix-hairpin-helix motif protein  31.48 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2745  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  49.02 
 
 		 200 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000236948  normal  0.898271 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2104  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  43.48 
 
 		 201 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1657  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  38.37 
 
 		 226 aa  53.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.11522  hitchhiker  0.000932836 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0740  DNA uptake/competence protein  31.68 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  5.4977199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3191  helix-hairpin-helix motif protein  39.44 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.732277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2548  hypothetical protein  28.95 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1103  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  43.33 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000407291  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12460  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  36.78 
 
 		 285 aa  51.6  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.214678  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1704  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  32.43 
 
 		 227 aa  51.2  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5114  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  57.38 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.668052 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1230  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  44.44 
 
 		 296 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.890666  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1668  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  36.47 
 
 		 206 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4318  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  37.5 
 
 		 216 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4563  hypothetical protein  41.38 
 
 		 212 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00101881 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1025  helix-hairpin-helix motif protein  42.37 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0837725  normal  0.434373 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3498  hypothetical protein  36.46 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3472  hypothetical protein  32.17 
 
 		 332 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.33558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  38.98 
 
 		 545 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1761  hypothetical protein  30.7 
 
 		 345 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1302  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.62 
 
 		 309 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10240  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  35.8 
 
 		 243 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.773806  hitchhiker  0.000000381007 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4885  hypothetical protein  38.1 
 
 		 183 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0570  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  37.14 
 
 		 224 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000494468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1562  Helix-hairpin-helix DNA-binding class 1  57.14 
 
 		 261 aa  45.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07770  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  41.94 
 
 		 255 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.734048 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  52.63 
 
 		 590 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2451  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  41.94 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1953  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  37.18 
 
 		 238 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00139923  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2033  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  35.48 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000281796  hitchhiker  0.000016405 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2512  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  35.94 
 
 		 213 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0805  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  34.15 
 
 		 250 aa  44.7  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3848  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  36.67 
 
 		 279 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2839  hypothetical protein  30.77 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0943  comEA protein  48.98 
 
 		 262 aa  44.3  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4421  hypothetical protein  38.1 
 
 		 182 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.046952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3198  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  37.8 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  52.78 
 
 		 575 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1521  late competence protein required for DNA binding and uptake  38.33 
 
 		 231 aa  43.9  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1282  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.3 
 
 		 413 aa  43.5  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12930  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  35.38 
 
 		 245 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149409  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  42.11 
 
 		 551 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  36.67 
 
 		 585 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2665  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.93 
 
 		 361 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197642  normal  0.42008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  40 
 
 		 543 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2071  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  46.43 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1336  hypothetical protein  43.75 
 
 		 379 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00270043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  42.11 
 
 		 551 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1520  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  37.5 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216127  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5471  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  40.91 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3915  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  52.78 
 
 		 269 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13270  DNA uptake protein  56.25 
 
 		 301 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3304  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  38.71 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0506678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  27.18 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0462  ComE operon protein 1  38.81 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1233  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  52.38 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1000  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  39.34 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4931  hypothetical protein  36.21 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.51 
 
 		 587 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1869  hypothetical protein  34.33 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00710485  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1109  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.294059  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0773  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.21 
 
 		 250 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.466163  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0826  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  43.75 
 
 		 355 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0217462  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  28.57 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2245  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  48.57 
 
 		 326 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1787  hypothetical protein  40 
 
 		 342 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  43.1 
 
 		 545 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  43.1 
 
 		 545 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1741  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  38.27 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3267  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  52.94 
 
 		 271 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00676892  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3010  competence protein ComEA  39.02 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1066  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  34.92 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0922  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  34.92 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3469  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  33.33 
 
 		 280 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.389617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4496  hypothetical protein  36.21 
 
 		 199 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0369659  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4178  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  33.33 
 
 		 199 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.666456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>