55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2665 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2665  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 361 aa  731    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197642  normal  0.42008 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0008  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.56 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.203843  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0995  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.82 
 
 		 277 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2274  Deoxyribonuclease I-like protein  30.08 
 
 		 252 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0118  putative nuclease  30.07 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0034  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.75 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  46.77 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0367  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.56 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0277145  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.6 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000154611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2969  hypothetical protein  23.02 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0376356  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1282  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.32 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1302  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.32 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0459  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.83 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290109 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1311  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  52.63 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0682087  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2038  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  44.23 
 
 		 130 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0715  hypothetical protein  34.62 
 
 		 274 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3191  helix-hairpin-helix motif protein  43.86 
 
 		 111 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.732277 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  33.02 
 
 		 181 aa  50.1  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3047  helix-hairpin-helix motif protein  42.31 
 
 		 116 aa  49.7  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  33.02 
 
 		 181 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1704  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  43.1 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03051  late competence protein (DNA binding and uptake)  34.12 
 
 		 105 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.724355  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1122  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  40.35 
 
 		 235 aa  47.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.266281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1520  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  42.11 
 
 		 107 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216127  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1647  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  36.84 
 
 		 225 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  32.35 
 
 		 543 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1682  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  36.84 
 
 		 225 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00173147  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0934  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  33.33 
 
 		 211 aa  46.6  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.800656  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0011  competence protein ComEA  40.35 
 
 		 79 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00025095  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0725  hypothetical protein  30.77 
 
 		 477 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.467555 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1657  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  47.27 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.11522  hitchhiker  0.000932836 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0037  competence protein ComEA  40.35 
 
 		 79 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0368973  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2033  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  36.51 
 
 		 93 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000281796  hitchhiker  0.000016405 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1691  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  42.62 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.176877  unclonable  0.000000000719685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3571  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  50.91 
 
 		 109 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319885  normal  0.0118873 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0010  competence protein ComEA  40.35 
 
 		 79 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2489  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  35.71 
 
 		 99 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.632838  normal  0.0131987 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2512  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  30 
 
 		 213 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1668  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  36.51 
 
 		 206 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1635  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  37.14 
 
 		 228 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1508  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  44.44 
 
 		 127 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5921  helix-hairpin-helix motif protein  50 
 
 		 129 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.946109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  33.77 
 
 		 502 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3053  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  33.33 
 
 		 200 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2156  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  37.93 
 
 		 90 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.367346  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1145  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.28 
 
 		 473 aa  43.5  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0301783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3093  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  37.31 
 
 		 107 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182901 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0558  Fis family transcriptional regulator  45 
 
 		 99 aa  43.9  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.340752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1429  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.67 
 
 		 220 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0894635  hitchhiker  0.000989669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1758  DNA uptake protein and related DNA-binding proteins  37.93 
 
 		 110 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3544  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  39.29 
 
 		 112 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1741  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  41.07 
 
 		 184 aa  43.1  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1589  DNA uptake protein related DNA-binding protein  29.79 
 
 		 211 aa  42.7  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.821877  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3612  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  39.29 
 
 		 112 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.393619  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1562  Helix-hairpin-helix DNA-binding class 1  40 
 
 		 261 aa  42.7  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>