291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1314 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
363 aa  728    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  34.59 
 
 
502 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  40.43 
 
 
451 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  31.48 
 
 
443 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  34.23 
 
 
291 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  34.23 
 
 
292 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  39.76 
 
 
367 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  37.21 
 
 
390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  36.25 
 
 
454 aa  162  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 
283 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  34.57 
 
 
300 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  36.44 
 
 
461 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  35.66 
 
 
421 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  35.63 
 
 
461 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  35.1 
 
 
294 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  35.22 
 
 
461 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  35.25 
 
 
320 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  34.82 
 
 
461 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  34.82 
 
 
461 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  34.02 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  33.97 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  33.97 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  33.97 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  32.26 
 
 
286 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  33.97 
 
 
300 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  34.36 
 
 
300 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  33.59 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  34.29 
 
 
300 aa  146  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  33.59 
 
 
300 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  32.31 
 
 
352 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.63 
 
 
778 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 
300 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  34.47 
 
 
300 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0715  hypothetical protein  38.16 
 
 
274 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  36.1 
 
 
348 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  33.98 
 
 
281 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2727  beta-lactamase domain protein  36.26 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  29.1 
 
 
284 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 
295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 
451 aa  139  6e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4102  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 
386 aa  139  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
453 aa  138  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0044  beta-lactamase-like protein  35.68 
 
 
291 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  28.78 
 
 
406 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  33.08 
 
 
318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2772  beta-lactamase-like  31.25 
 
 
257 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.619488  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.84 
 
 
770 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.4 
 
 
773 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.37 
 
 
757 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.4 
 
 
773 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.28 
 
 
761 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1579  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.85 
 
 
883 aa  123  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0482933  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  30.08 
 
 
336 aa  123  6e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.02 
 
 
654 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.02 
 
 
773 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  31.62 
 
 
773 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.89 
 
 
809 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.58 
 
 
814 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2092  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  33.73 
 
 
331 aa  120  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214294  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.85 
 
 
775 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.44 
 
 
750 aa  119  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.22 
 
 
752 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.12 
 
 
818 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 
479 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.7 
 
 
840 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2636  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.58 
 
 
856 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0667077  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1693  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.58 
 
 
842 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.891985  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2715  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.58 
 
 
842 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1471  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.58 
 
 
856 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.300879  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3120  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.58 
 
 
856 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2198  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.58 
 
 
856 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2581  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.58 
 
 
856 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.82 
 
 
780 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.99 
 
 
771 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.48 
 
 
798 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.59 
 
 
766 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1890  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.45 
 
 
845 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.41 
 
 
772 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.41 
 
 
772 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2499  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 
783 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304772 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.55 
 
 
785 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.06 
 
 
811 aa  113  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.36 
 
 
773 aa  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.81 
 
 
745 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.64 
 
 
789 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.96 
 
 
773 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5417  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.3 
 
 
830 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560238  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.62 
 
 
759 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.44 
 
 
786 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2129  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.61 
 
 
829 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326593  normal  0.0900672 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1120  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  32.53 
 
 
847 aa  110  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.511509 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.2 
 
 
777 aa  109  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.57 
 
 
773 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.3 
 
 
839 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1159  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.99 
 
 
819 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785752 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5966  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.51 
 
 
829 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2111  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.51 
 
 
829 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.261797  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.52 
 
 
840 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.25 
 
 
797 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1942  beta-lactamase-like  30.2 
 
 
423 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>