28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_A0008 on replicon NC_007483
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007483  Noc_A0008  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 398 aa  819    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.203843  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2665  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.54 
 
 		 361 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197642  normal  0.42008 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0995  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.47 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2274  Deoxyribonuclease I-like protein  35.32 
 
 		 252 aa  113  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0034  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.83 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3773  hypothetical protein  40 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0118  putative nuclease  25.35 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  40.82 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  40.22 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.51 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000154611 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0606  competence-like protein  34.38 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.216559  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1867  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0121854 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2969  hypothetical protein  28.41 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0376356  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0367  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.02 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0277145  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0459  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.7 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7022  hypothetical protein  29.41 
 
 		 158 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3047  hypothetical protein  38.67 
 
 		 986 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.845635  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0715  hypothetical protein  31.78 
 
 		 149 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.100612  normal  0.0883598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  30.86 
 
 		 1051 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0108  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.14 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.94824  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  30.11 
 
 		 1931 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02760  hypothetical protein  28.57 
 
 		 164 aa  44.3  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4471  hypothetical protein  27.27 
 
 		 155 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf075  membrane nuclease A  23.65 
 
 		 466 aa  43.5  0.006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.117441  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.97 
 
 		 242 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2457  hypothetical protein  36 
 
 		 274 aa  43.1  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0815  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.36 
 
 		 471 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.044301  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>