103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0108 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0108  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 
420 aa  854    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.94824  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2671  DNA/RNA non-specific endonuclease  45.06 
 
 
470 aa  256  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0295423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1138  DNA/RNA non-specific endonuclease  55.74 
 
 
356 aa  256  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3644  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.09 
 
 
279 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000556838  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2726  DNA/RNA non-specific endonuclease  43.22 
 
 
269 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.564947  normal  0.0294848 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0336  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.15 
 
 
274 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2952  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.11 
 
 
342 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0320896 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2616  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.21 
 
 
446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0874115  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6632  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.54 
 
 
289 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.152163 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08316  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.96 
 
 
471 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4000  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.6 
 
 
281 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1431  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.99 
 
 
265 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3773  hypothetical protein  45.61 
 
 
259 aa  103  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0792  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.34 
 
 
356 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.275213 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00665  putative endonuclease  28.06 
 
 
269 aa  96.7  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0795494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2129  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.25 
 
 
283 aa  96.3  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000700063 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0413  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.46 
 
 
293 aa  92  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1871  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.37 
 
 
263 aa  90.1  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000105859  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02818  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.03 
 
 
232 aa  90.1  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5415  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.39 
 
 
293 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2089  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.53 
 
 
283 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0175  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.57 
 
 
268 aa  87.4  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000379253  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0363  DNA/RNA non-specific endonuclease  45.36 
 
 
348 aa  87.4  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4899  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.33 
 
 
265 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835138  normal  0.203553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3924  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.57 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204737  hitchhiker  0.000259019 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4799  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.81 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0364  DNA/RNA non-specific endonuclease  44.33 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.761571 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1828  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.55 
 
 
291 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2213  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.36 
 
 
291 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.718467  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0081  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.07 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1937  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.36 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0092281  normal  0.635085 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2565  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.6 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000966984  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3398  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.02 
 
 
248 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0744  putative DNA/RNA non-specific endonuclease protein  33.11 
 
 
275 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0233  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.55 
 
 
268 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4634  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.89 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0693957  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2295  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.51 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000402922  decreased coverage  0.000101093 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5192  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.98 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6268  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.72 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1560  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.27 
 
 
305 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.450692  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5224  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.27 
 
 
305 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4118  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.73 
 
 
249 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7050  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.04 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108993 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79520  Mitochondrial nuclease  27.02 
 
 
325 aa  75.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.553306  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02185  endodeoxyribonuclease (Eurofung)  27.75 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.221302 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2047  DNA/RNA non-specific endonuclease (Mg-dependent)  38.38 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000019362  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2350  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.38 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000288623  hitchhiker  0.00789181 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2787  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.14 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.148277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0715  hypothetical protein  37.93 
 
 
149 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.100612  normal  0.0883598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7139  DNA/RNA non-specific endonuclease  43.3 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4471  hypothetical protein  37.62 
 
 
155 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0606  competence-like protein  39.62 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.216559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3461  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.57 
 
 
300 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2226  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.95 
 
 
229 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2053  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.68 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02760  hypothetical protein  34.65 
 
 
164 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29947  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6354  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.89 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  41 
 
 
1931 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0573  endonuclease  26.32 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  40.86 
 
 
421 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1810  nuclease  25.97 
 
 
265 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000251579  unclonable  0.0000000338586 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  39.62 
 
 
301 aa  66.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0885  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.03 
 
 
283 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.167923  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0414  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.64 
 
 
277 aa  65.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  44.9 
 
 
479 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1834  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.58 
 
 
294 aa  63.2  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1905  hypothetical protein  37.39 
 
 
333 aa  63.2  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03360  nuclease, putative  31.21 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0170398  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4319  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.37 
 
 
315 aa  62.4  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1867  beta-lactamase domain protein  35.79 
 
 
477 aa  58.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0121854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0924  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.73 
 
 
422 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1028  endonuclease  24.84 
 
 
319 aa  57  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600333  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2962  DNA/RNA non-specific endonuclease  30 
 
 
351 aa  57  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3176  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.21 
 
 
309 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2261  hypothetical protein  32.81 
 
 
331 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000590527  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7022  hypothetical protein  30.16 
 
 
158 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0566  DNA/RNA non-specific endonuclease  43.86 
 
 
217 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00041996  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0630  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.04 
 
 
170 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.826915 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1441  DNA/RNA non-specific endonuclease  43.86 
 
 
217 aa  54.3  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4380  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.48 
 
 
189 aa  53.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1443  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.88 
 
 
388 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1459  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.88 
 
 
284 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000101242  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2014  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.88 
 
 
284 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2842  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  34 
 
 
416 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0933431  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1212  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.87 
 
 
348 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0090  putative endonuclease  24.05 
 
 
283 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.670924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1427  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.44 
 
 
284 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000987613  decreased coverage  0.000225479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1841  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.44 
 
 
284 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000036697  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29606  predicted protein  36.14 
 
 
330 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0259516  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6229  predicted protein  30.97 
 
 
224 aa  50.1  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2076  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.78 
 
 
246 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0008  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.14 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.203843  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4436  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.5 
 
 
311 aa  47.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0934  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.72 
 
 
217 aa  46.6  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.311565  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0622  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.93 
 
 
216 aa  46.6  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17136  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0697  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.93 
 
 
216 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2474  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.28 
 
 
316 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2239  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.86 
 
 
314 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0799  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.62 
 
 
669 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  34.18 
 
 
654 aa  43.9  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>