79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3176 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3176  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 		 309 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4436  DNA/RNA non-specific endonuclease  51.85 
 
 		 311 aa  272  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2474  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.54 
 
 		 316 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2239  DNA/RNA non-specific endonuclease  44.29 
 
 		 314 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47090  putative protease  45.9 
 
 		 642 aa  221  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  46.01 
 
 		 644 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.52 
 
 		 686 aa  189  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0770  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.37 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  41.77 
 
 		 631 aa  179  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2957  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.62 
 
 		 272 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  37.46 
 
 		 741 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0799  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.01 
 
 		 669 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.5 
 
 		 721 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.45 
 
 		 724 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0949  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.78 
 
 		 337 aa  155  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0787893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1035  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.51 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.969234  normal  0.342127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.44 
 
 		 720 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0924  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.36 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2530  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.89 
 
 		 743 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3581  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.34 
 
 		 701 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.410045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3304  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.94 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2812  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.94 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.750858  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7139  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.9 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6354  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.97 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1138  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.61 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08316  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.18 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0336  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.23 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0885  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.75 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.167923  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4634  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.05 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0693957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2726  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.5 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.564947  normal  0.0294848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1828  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.78 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2671  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.63 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0295423  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4000  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.46 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1937  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.25 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0092281  normal  0.635085 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2213  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.87 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.718467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0233  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.6 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0413  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.29 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6268  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.01 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2129  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.43 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000700063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3398  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.85 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0108  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.21 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.94824  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3644  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.29 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000556838  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1560  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.79 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.450692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5224  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.79 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0414  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.5 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0175  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.77 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000379253  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0573  endonuclease  31.48 
 
 		 256 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0744  putative DNA/RNA non-specific endonuclease protein  30.82 
 
 		 275 aa  53.5  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1212  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.69 
 
 		 348 aa  52.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2565  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.8 
 
 		 267 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000966984  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2047  DNA/RNA non-specific endonuclease (Mg-dependent)  27.84 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000019362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2226  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.64 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2350  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.84 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000288623  hitchhiker  0.00789181 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2295  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.42 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000402922  decreased coverage  0.000101093 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2787  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.79 
 
 		 272 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.148277  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1834  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.26 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0081  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.85 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1028  endonuclease  27.81 
 
 		 319 aa  49.7  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600333  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0363  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.37 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5415  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.37 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1871  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.88 
 
 		 263 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000105859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2952  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.62 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0320896 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2089  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.65 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02185  endodeoxyribonuclease (Eurofung)  28.97 
 
 		 334 aa  46.6  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.221302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2053  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.11 
 
 		 321 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2076  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.81 
 
 		 246 aa  46.2  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4799  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.34 
 
 		 359 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2616  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.15 
 
 		 446 aa  45.8  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0874115  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1431  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.26 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6632  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.35 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0792  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.03 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.275213 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4899  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.66 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835138  normal  0.203553 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0364  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.8 
 
 		 341 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.761571 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6229  predicted protein  25 
 
 		 224 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00665  putative endonuclease  26.61 
 
 		 269 aa  43.5  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0795494  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5192  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.48 
 
 		 235 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3924  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.27 
 
 		 342 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204737  hitchhiker  0.000259019 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0630  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.87 
 
 		 170 aa  42.7  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.826915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2420  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.5 
 
 		 802 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352257  normal  0.785952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>