37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3581 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3581  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 
701 aa  1437    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.410045  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2530  DNA/RNA non-specific endonuclease  43.58 
 
 
743 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.65 
 
 
686 aa  246  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0799  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.11 
 
 
669 aa  187  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.88 
 
 
721 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1680  hypothetical protein  38.65 
 
 
314 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.3 
 
 
644 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47090  putative protease  38.52 
 
 
642 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  27.89 
 
 
631 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  31.96 
 
 
741 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2239  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.8 
 
 
314 aa  125  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2474  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.03 
 
 
316 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169636  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.79 
 
 
720 aa  118  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0770  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.63 
 
 
273 aa  115  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2957  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.91 
 
 
272 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.76 
 
 
724 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4436  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.83 
 
 
311 aa  110  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3413  hypothetical protein  34.63 
 
 
961 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0649675  normal  0.019371 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3176  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.69 
 
 
309 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1035  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.48 
 
 
305 aa  106  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.969234  normal  0.342127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3173  hypothetical protein  32.71 
 
 
389 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.87 
 
 
404 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.61506 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0949  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.53 
 
 
337 aa  100  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0787893  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4439  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.88 
 
 
850 aa  85.1  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2812  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.69 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.750858  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3304  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.98 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0924  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.15 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6385  peptidase  25.61 
 
 
952 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1431  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.07 
 
 
265 aa  55.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0792  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.86 
 
 
356 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.275213 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0413  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.95 
 
 
293 aa  50.8  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  31.07 
 
 
418 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  31.07 
 
 
418 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0885  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.84 
 
 
283 aa  45.8  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.167923  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2076  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.39 
 
 
246 aa  45.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2442  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.62 
 
 
259 aa  44.3  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000823282  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0718  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.75 
 
 
424 aa  43.9  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>