53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2291 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 
721 aa  1442    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  38.98 
 
 
631 aa  399  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.34 
 
 
724 aa  261  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  50.56 
 
 
741 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  39.55 
 
 
694 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  44.49 
 
 
677 aa  194  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4436  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.6 
 
 
311 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2516  hypothetical protein  39.93 
 
 
401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2474  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.54 
 
 
316 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2239  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.58 
 
 
314 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0799  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.04 
 
 
669 aa  163  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3176  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.25 
 
 
309 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2957  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.12 
 
 
272 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3581  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.64 
 
 
701 aa  152  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.410045  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47090  putative protease  37.55 
 
 
642 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1035  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.45 
 
 
305 aa  145  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.969234  normal  0.342127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.42 
 
 
720 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.92 
 
 
644 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0770  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.2 
 
 
273 aa  141  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2530  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.54 
 
 
743 aa  140  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.7 
 
 
686 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2816  serine protease  33.58 
 
 
348 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114661  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0949  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.94 
 
 
337 aa  110  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0787893  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3304  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.31 
 
 
301 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2812  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.31 
 
 
301 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.750858  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0924  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.07 
 
 
422 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3556  hypothetical protein  32.58 
 
 
369 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0917866  normal  0.0496884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3473  hypothetical protein  31.19 
 
 
356 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145252  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2418  hypothetical protein  33.87 
 
 
363 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3749  hypothetical protein  31.47 
 
 
572 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2531  hypothetical protein  32.84 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0023  PKD repeat-containing protein  30.08 
 
 
385 aa  62  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0414  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.66 
 
 
277 aa  61.6  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3032  hypothetical protein  34.32 
 
 
328 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788507  normal  0.0112295 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0571  hypothetical protein  44.12 
 
 
564 aa  55.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4310  hypothetical protein  28.1 
 
 
356 aa  55.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0885  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.73 
 
 
283 aa  54.3  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.167923  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0726  hypothetical protein  33.73 
 
 
338 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62736  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3160  PKD repeat-containing protein  29.19 
 
 
396 aa  52  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.843652  hitchhiker  0.0000187562 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4634  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.14 
 
 
297 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0693957  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  24.55 
 
 
476 aa  48.9  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10126  serine protease pepA  27.06 
 
 
355 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.16358e-29  normal  0.942677 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0081  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.12 
 
 
298 aa  47.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.8 
 
 
544 aa  47.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7139  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.94 
 
 
309 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1784  peptidase, S1A (chymotrypsin) family  29.35 
 
 
273 aa  46.6  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.718326  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6354  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.23 
 
 
295 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02448  protease  25.93 
 
 
482 aa  45.8  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  28.35 
 
 
412 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1028  endonuclease  31.95 
 
 
319 aa  45.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600333  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.63 
 
 
632 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1805  S1A family peptidase  28.86 
 
 
273 aa  44.3  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1431  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.71 
 
 
265 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>