88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2726 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2726  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 
269 aa  546  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.564947  normal  0.0294848 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0336  DNA/RNA non-specific endonuclease  55.64 
 
 
274 aa  298  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2671  DNA/RNA non-specific endonuclease  52.61 
 
 
470 aa  270  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0295423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1138  DNA/RNA non-specific endonuclease  54.96 
 
 
356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4000  DNA/RNA non-specific endonuclease  51.67 
 
 
281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6632  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.31 
 
 
289 aa  249  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.152163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2616  DNA/RNA non-specific endonuclease  50.61 
 
 
446 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0874115  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3644  DNA/RNA non-specific endonuclease  43.12 
 
 
279 aa  231  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000556838  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08316  DNA/RNA non-specific endonuclease  44.67 
 
 
471 aa  223  4e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2952  DNA/RNA non-specific endonuclease  45.11 
 
 
342 aa  218  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0320896 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0108  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.74 
 
 
420 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.94824  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2129  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.3 
 
 
283 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000700063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0792  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.84 
 
 
356 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.275213 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2089  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.49 
 
 
283 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00665  putative endonuclease  30.18 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0795494  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1431  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.37 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0413  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.3 
 
 
293 aa  92  8e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0081  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.5 
 
 
298 aa  87.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2047  DNA/RNA non-specific endonuclease (Mg-dependent)  34.97 
 
 
302 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000019362  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2350  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.97 
 
 
302 aa  87  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000288623  hitchhiker  0.00789181 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79520  Mitochondrial nuclease  29.73 
 
 
325 aa  86.7  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.553306  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2295  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.82 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000402922  decreased coverage  0.000101093 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1871  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.37 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000105859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0233  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.21 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0885  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.34 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.167923  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1828  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.79 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0175  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.21 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000379253  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7139  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.34 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0414  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.35 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2213  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.46 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.718467  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6268  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.93 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1937  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.46 
 
 
297 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0092281  normal  0.635085 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02185  endodeoxyribonuclease (Eurofung)  27.49 
 
 
334 aa  79  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.221302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2565  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.76 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000966984  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1834  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.71 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2787  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.65 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.148277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02818  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.79 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0573  endonuclease  24.79 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5415  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.21 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0363  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.65 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0364  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.22 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.761571 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1028  endonuclease  24.79 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600333  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3398  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.95 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6354  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.03 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2226  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.14 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0744  putative DNA/RNA non-specific endonuclease protein  25.54 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4634  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.9 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0693957  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0934  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.57 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.311565  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03360  nuclease, putative  25.54 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0170398  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3924  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.85 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204737  hitchhiker  0.000259019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1560  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.44 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.450692  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5224  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.44 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3461  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.95 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4799  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.52 
 
 
359 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7050  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.57 
 
 
211 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1810  nuclease  25.31 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000251579  unclonable  0.0000000338586 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4118  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.4 
 
 
249 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0090  putative endonuclease  29.65 
 
 
283 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.670924  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6229  predicted protein  23.89 
 
 
224 aa  63.5  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4899  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.39 
 
 
265 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835138  normal  0.203553 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0697  DNA/RNA non-specific endonuclease  25 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2053  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.46 
 
 
321 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0566  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.48 
 
 
217 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00041996  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3176  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.5 
 
 
309 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1441  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.85 
 
 
217 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2962  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.72 
 
 
351 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1075  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.7 
 
 
216 aa  57  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.510114  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.32 
 
 
644 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29606  predicted protein  30.3 
 
 
330 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0259516  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0622  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.32 
 
 
216 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17136  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0630  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.75 
 
 
170 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.826915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1212  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.7 
 
 
348 aa  56.2  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47090  putative protease  25.32 
 
 
642 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2239  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.37 
 
 
314 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2474  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.93 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169636  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4319  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.19 
 
 
315 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2076  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.87 
 
 
246 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  23.75 
 
 
631 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1443  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.43 
 
 
388 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2014  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.43 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1841  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.43 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000036697  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1459  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.32 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000101242  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5192  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.86 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1427  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.32 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000987613  decreased coverage  0.000225479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.65 
 
 
686 aa  49.3  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4380  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.57 
 
 
189 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4436  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.9 
 
 
311 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0770  DNA/RNA non-specific endonuclease  20.34 
 
 
273 aa  42.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>