51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2957 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2957  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 
272 aa  531  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0770  DNA/RNA non-specific endonuclease  54.98 
 
 
273 aa  266  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1035  DNA/RNA non-specific endonuclease  57.09 
 
 
305 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.969234  normal  0.342127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3176  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.62 
 
 
309 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.1 
 
 
644 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47090  putative protease  38.72 
 
 
642 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2239  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.38 
 
 
314 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4436  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.85 
 
 
311 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2474  DNA/RNA non-specific endonuclease  39 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169636  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  43.17 
 
 
721 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0799  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.31 
 
 
669 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  41.77 
 
 
741 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  37.24 
 
 
631 aa  155  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0949  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.91 
 
 
337 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0787893  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.33 
 
 
686 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.06 
 
 
720 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.75 
 
 
724 aa  129  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3581  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.91 
 
 
701 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.410045  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0924  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.94 
 
 
422 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2530  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.77 
 
 
743 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2812  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.37 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.750858  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3304  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.12 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5415  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.07 
 
 
293 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6268  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.06 
 
 
304 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6354  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.33 
 
 
295 aa  52  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1871  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.93 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000105859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0792  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.05 
 
 
356 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.275213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1828  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.95 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2213  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.4 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.718467  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5192  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.12 
 
 
235 aa  49.7  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3461  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.17 
 
 
300 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4799  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.41 
 
 
359 aa  49.3  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1937  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.58 
 
 
297 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0092281  normal  0.635085 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0233  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.56 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0336  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.81 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0081  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.08 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0413  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.29 
 
 
293 aa  47  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4634  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.65 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0693957  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7139  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.71 
 
 
309 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79520  Mitochondrial nuclease  25.34 
 
 
325 aa  47  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.553306  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3398  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.64 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2129  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.51 
 
 
283 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000700063 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2565  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.67 
 
 
267 aa  46.2  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000966984  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4899  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.8 
 
 
265 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835138  normal  0.203553 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4118  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.71 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1212  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.68 
 
 
348 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1431  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.41 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7050  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.83 
 
 
211 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108993 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3924  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.48 
 
 
342 aa  43.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204737  hitchhiker  0.000259019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2053  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.86 
 
 
321 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02818  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.87 
 
 
232 aa  42.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>