44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3250 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 		 686 aa  1420    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3581  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.65 
 
 		 701 aa  241  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.410045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0949  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.86 
 
 		 337 aa  210  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0787893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2239  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.88 
 
 		 314 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.97 
 
 		 644 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2474  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.48 
 
 		 316 aa  193  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169636  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  29.4 
 
 		 631 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47090  putative protease  38.6 
 
 		 642 aa  191  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3176  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.52 
 
 		 309 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2530  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.31 
 
 		 743 aa  183  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4436  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.86 
 
 		 311 aa  175  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3413  hypothetical protein  33.93 
 
 		 961 aa  157  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0649675  normal  0.019371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1035  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.04 
 
 		 305 aa  152  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.969234  normal  0.342127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0799  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.55 
 
 		 669 aa  145  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  36.84 
 
 		 741 aa  144  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0770  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.83 
 
 		 273 aa  143  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2957  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.33 
 
 		 272 aa  140  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.06 
 
 		 724 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.42 
 
 		 721 aa  137  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1680  hypothetical protein  33.92 
 
 		 314 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.66 
 
 		 720 aa  114  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0924  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.68 
 
 		 422 aa  109  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3304  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.43 
 
 		 301 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2812  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.07 
 
 		 301 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.750858  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4439  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.04 
 
 		 850 aa  100  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.21 
 
 		 404 aa  93.6  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.61506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3173  hypothetical protein  28.78 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6385  peptidase  29.9 
 
 		 952 aa  78.2  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0336  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.87 
 
 		 274 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2420  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.1 
 
 		 802 aa  52  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352257  normal  0.785952 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3644  DNA/RNA non-specific endonuclease  21.9 
 
 		 279 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000556838  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0414  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.52 
 
 		 277 aa  50.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1138  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.03 
 
 		 356 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2726  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.65 
 
 		 269 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.564947  normal  0.0294848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4000  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.63 
 
 		 281 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1834  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.22 
 
 		 294 aa  49.3  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2671  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.35 
 
 		 470 aa  47.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0295423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1130  glutamyl endopeptidase  27.27 
 
 		 342 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000101388  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1107  glutamyl endopeptidase  27.27 
 
 		 342 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000076539  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4380  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.97 
 
 		 189 aa  47  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2076  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.77 
 
 		 246 aa  46.2  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1397  glutamyl endopeptidase precursor SspA  25.14 
 
 		 282 aa  44.3  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0630  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.56 
 
 		 170 aa  44.3  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.826915 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1028  endonuclease  24 
 
 		 319 aa  43.9  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>