27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1680 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1680  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  630  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3581  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.65 
 
 		 701 aa  149  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.410045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.89 
 
 		 644 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47090  putative protease  38.49 
 
 		 642 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.92 
 
 		 686 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2530  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.98 
 
 		 743 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0799  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.27 
 
 		 669 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3413  hypothetical protein  29.6 
 
 		 961 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0649675  normal  0.019371 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.88 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.61506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3173  hypothetical protein  27.2 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4439  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.14 
 
 		 850 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6385  peptidase  26.62 
 
 		 952 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1397  glutamyl endopeptidase precursor SspA  27.92 
 
 		 282 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1966  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 		 578 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1107  glutamyl endopeptidase  26.9 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000076539  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1130  glutamyl endopeptidase  26.9 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000101388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5907  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.21 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3571  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  33.33 
 
 		 701 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.226926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  30.11 
 
 		 395 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  30.7 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.94 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.37 
 
 		 266 aa  43.9  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00538028  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  24.56 
 
 		 481 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4050  hypothetical protein  30.34 
 
 		 629 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35522  normal  0.114627 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  28.49 
 
 		 490 aa  42.7  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  28.49 
 
 		 476 aa  42.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2582  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  25.59 
 
 		 352 aa  42.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.236237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>